根据辐射系列的尿性，以及其他系列游戏的尿性，本作被灭掉的势力，基本都会有余党出现甚至成为下一作的主要线索。。
目前根据多方验证，辐射4的官方结局大约是兄弟会领导波士顿或者老爹带着学院改进废土生态。。铁路的三人奇袭就是个逗逼结局。应该是黑历史。至于义勇军，无论在哪都会存在且是辅助性质的，因为只能算民兵组织帮大家排忧解难而不能领导废土。。
如果是兄弟会结局是官方的，参照辐射2，3里面被打残的教主余孽和英克雷散兵，从学院逃出来的科学家和合成人可能会成为一个势力，对抗兄弟会，毕竟波士顿里那些变种人，掠夺者甚至枪手不算是主线的势力，只是升级的对象，，B社要继续，就得塑造新的敌人或者把以前的敌人重新打包放出。。波士顿只剩下兄弟会和义勇军势力了，也不可能凭空造出新另外的BOSS，所以就把学院余孽拿出来凑合用着。。。
学院是官方结局。。那就是可能新一波的兄弟会前来挑战，或者是逃跑的合成人组成势力来对抗学院的召回。。至于铁路。连老大+重炮手都死光了，剩下精神不正常的探员。是不可能再出现的，除非铁路总部只是个幌子，在美利坚其他地方才有真正的总部，才有可能在续集或者DLC里登场。但就目前终端记录显示。。铁路只此波士顿一家，别无分店，连PAM这种秘密武器都被剿灭了，还能指望啥？铁路不像英克雷，士兵和士官有着绝对的军事化训练和洗脑，除了少数重炮手，其他都是民间来的土人罢了。更不会有振兴铁路的意识，看看那些总部的探员，还有做任务碰到的探员，基本都是人心惶惶，精神病患者，都不想给铁路卖命了。