性格内向的乡村少年莲见雄一，是莉莉周的忠实歌迷。他在互联网上建立了关于莉莉周的网页，以菲利亚（philia）的网名主持歌迷聊天室。
雄一整天沉迷于莉莉周音乐的虚幻世界中；有时他也混迹于不良少年中，在郊区列车上和宇都宫车站音像店里从事盗窃活动。

一天，和伙伴们在旧货店销赃时，雄一意外发现了一幅被丢弃的过期的莉莉周海报——莉莉周在横滨，他如获至宝，费了九牛二虎之力，才用自行车把它运回家中。
电视里报道着郊区列车上的少年盗窃案，雄一的父母哪里知道，自己看上去循规蹈矩的儿子也参与其中。
最近雄一在网上交流最多的，是一个名叫青猫的网友，他似乎对莉莉周无所不知，对音乐的理解，和雄一也称得上是英雄所见略同。
听说莉莉周出版了新的CD，雄一迫不及待地来到熟悉的车站音像店。父亲刚给他的零用钱被伙伴抢走了，身无分文的雄一不动声色地把CD放入书包，不料在溜出商店时被店员抓获。

雄一的级任老师小山内被通知来音像店领人，她替雄一买下了莉莉周的最新CD《呼吸》，在返回学校的途中，年轻的女老师和雄一一起，欣赏着其中的主打歌曲《阿拉古斯古》。
莉莉周空灵、悠扬的音乐，让雄一立刻沉醉其中；《阿拉古斯古》那似曾相识的曲调，令他忘记了眼前的烦恼。
老师将雄一的母亲找到学校，儿子的不良行为令母亲无地自容。可是此刻雄一心中只有莉莉周亦真亦幻的歌声，脑海里浮现出薄雾弥漫的紫色天空，如此神秘，如此纯净，那是属于莉莉周的天空，是雄一最后的净土。

雄一骑着单车穿过绿色的田野，带母亲回家，天气晴朗，阳光明媚，有莉莉周的日子里，雄一的心总能在天地间自由飞翔。
灾难伴随着夜色悄然降临。晚上，雄一正在家欣赏音乐，突然被同学星野修介叫了出去，随即遭到以星野为首的一伙同龄人的暴打，这些人都是雄一日间作案的伙伴。莉莉周的新CD被星野残忍地掰成两半，CD盒也被踩得支离破碎。雄一心中美妙的乐声嘎然而止。他痛苦地回忆起自己和星野的友谊，那真是一段难忘的往事。

一年前，雄一和星野从同一所小学升入同一所中学。在开学典礼上，星野代表全体新生发言。那时的星野，看上去朝气蓬勃，对生活充满希望。可是他的恃才傲物，得罪了学校高年级前辈和班上一群厉害的女生，常被她们集体围攻。雄一总毫无保留地支持是星野。

那时星野还是同学们心目中品学兼优的好学生，经常受到一帮坏小子的嘲弄，他只是淡然处之，倒是几个伙伴总为他打抱不平。
平淡无奇的一学期过去了，雄一他们在深受女生瞩目的剑术比赛中毫无建树，转眼到了暑假，几个男孩子决定到冲绳岛旅行，寻求刺激。
星野以一次突如其来的抢劫，奠定了自己在伙伴中的地位。他们用抢劫来的钱，实现了到冲绳岛旅行的梦想。

美丽的冲绳岛是度假的天堂。风情万种的导游小姐，陪伴着几个不谙世事的少年，白天在丛林探险，在海中戏水；夜晚在沙滩燃放烟花，寻找海龟的踪迹。导游小姐用民族乐器弹奏的《阿拉古斯古》，令星野神魂颠倒。
在这次旅行中，星野两次险些送命。一次被金枪鱼袭击，受了轻伤；一次溺水，被陌生的旅游者及时发现。当地司机告诉他，如果人们带不吉利的东西来小岛，就一定会在这里受到惩罚，丢掉自己的灵魂。

星野把剩下的钱扔进大海，在离开冲绳的途中，大家目睹了一起车祸，受害人正是救了星野的那位孤独的游客。飞机像一道犀利的闪电，划过苍青色的天空，冲绳岛之行在大家心中留下了重重的阴影。
雄一后来在网络上告诉青猫，那年暑假后，世界变成了灰色。

又开学了，星野身上突然发生了令人震惊的变化。他在全班同学面前残忍地惩罚了昔日的班级恶霸。目睹星野如此老练和毒辣的行为，雄一感到极端恐惧。遭到惩罚的坏小子被迫退学；决定退出团伙的雄一，也被星野他们毫不留情地打得鼻青脸肿。
雄一的内心世界，对现实彻底封闭了，莉莉周成为他唯一的精神寄托，沉默的雄一只在网络上向青猫和网友吐露心声。

星野仿佛受到某种邪恶力量的驱使，变本加厉地对所有人进行报复，甚至连同班女生也不放过。天真活泼的津田被迫向成年人提供性服务，少女的单纯世界被星野摧毁。津田暗恋上默默陪伴她的雄一；而面对另一个男生佐佐木的真诚爱情，她却不敢相信。最后，她终于带着对现实世界的迷茫，坠塔自杀。
与此同时，才华出众的女孩久野，被星野注意后也难逃厄运。雄一被迫将自己的梦中情人交给星野，女孩在一处废弃的厂房中遭到星野手下的强暴。
教室里，面对津田桌上祭奠的鲜花，和被强暴后的久野自己剃成光头，雄一受到严重刺激。他在网络上向青猫诉说内心的痛苦，请求他救救自己，带带自己离开这个混乱的世界。青猫鼓励他为了莉莉周勇敢地生存下去。

雄一独自在麦田里倾听莉莉周的声音，那是来自另一个世界的和平的声音，那是他和青猫心灵相约的地方，是他们最后的栖身之地。
雄一和青猫约定在莉莉周的演唱会上见面，接头暗号是青猫手拿一只青苹果。
演唱会盛况空前，雄一在广场上突然遇到了星野。星野强迫雄一去给自己买水，把一只青苹果塞给雄一，让他替自己等人，自己却夺走雄一的门票抢先进了大厅。

雄一绝望地在青苹果上发现了青猫的名字，原来青猫就是星野。而此时星野正在大门内高举雄一的入场券，让雄一亲眼看着自己将票揉成一团，扔在地上。
雄一的心被彻底击碎，他紧紧握着青苹果，在广场大屏幕上观看了可望而不可及的莉莉周演唱会。
在散场的人潮中，突然响起雄一歇嘶底里的惊呼：莉莉，莉莉在那儿啊！她在招手，是莉莉啊！

人们疯狂地向回涌动，雄一与人们反方向地走着，他挤到星野身边，然后离开。
星野倒在了血泊中。
人们出现混乱，雄一离开了会场。
铁道边，雄一拿出了那个插着匕首的青苹果。
雄一的世界平静了。
其实世界一直很平静。

心中最大的伤，是活着，我感受着伤口的愈合，生活会治愈你，从过去到未来。
         ——《关于莉莉周的一切》