据台湾媒体报道，台北市的经济重镇内湖科学园区，每天有超过10万人上班、年营收超过3兆新台币，但根据量测，内湖科学园区的土地是基隆河截弯取直而来，原本都是基隆河河床，烂泥层厚，全是软弱黏土，房屋基桩无法打到两百多公尺深的岩盘，台大地质系教授陈宏宇就担心，硬体设施若不够坚固，遇到强震，后果令人忧心。
陈宏宇是在中天新闻“国土地质大调查”节目中做出上述表示，他强调，内湖是旧河道地区，“下头势必是一些比较软弱的一些烂泥.那些烂泥里头，含有非常高量水，饱和地层势必水压，压力比较大，那你房子结构放在那个地方，很可能产生沉陷，很可能产生变形”。
由于士林夜市和剑潭捷运站也是基隆河填平之后的新生地，专家担心同样有软弱土壤问题，尤其在这样的土壤上盖房子，地震来袭时容易引发共振效应，如果大楼和盆地的地震晃动周期一致，摇晃程度会扩大，就有专家认为，严重的话，建筑物的5或6楼，可能会拦腰折断。
台北市土木技师公会拱祥生认为，“如果地震不是在台北发生，而是从中部发生的，它经由中南部传上来之后，它在桃园地震力会比较小，可是传到台北的地震力，可能因为有盆地效应的关系，因为我们是软弱地盘，会把地震力再放大”。
除了共振效应，台北盆地的建筑物还面临土壤液化威胁，依据台北市政府公布资料，包括社子岛、行天宫，还有被列为防灾公园的大安森林公园北半侧等10处，都被列为土壤液化红色警戒区，这边的砂质土壤如果遇到强震，减少砂石颗粒间的摩擦力，地层承载力恐怕会瞬间消失，房屋就容易倾斜或倒塌。
大台北地区有超过30万栋屋龄超过30年的老旧房屋，专家建议都市更新迫在眉睫，因为如果强震来袭，灾害将难以估算。