针对税费高问题，中上协从企业角度提炼归纳了24条建议，包括改革投融资体制、减少项目审批、放松市场准入、加强市场监管、加大知识产权保护、清理检查评比和认证项目、加快垄断领域改革、结构性减税、优化税制结构等方面。
1539家受访企业有93%的企业认为应将降低企业税负、简化税种作为税收体制改革的一项重要任务，并提出了三项建议。
一是实行结构性减税。
一些企业认为研发费加计扣除、固定资产加速折旧等政策是激励创新最有效、最公平的政策。如果支持创新的普惠性减税由目前的100多亿元上升到500亿元，其效果将胜过财政每年上千亿元的科技经费补贴，而且机制会更好。
二是规范行政性收费。
各类行政性收费已超过企业营业收入的1%，收费项目名目繁多，企业大多不清楚收费的依据和实际用途。某些地方缴费额已达企业营业收入的8%。建议国家组织一次行政性收费的清理，简政清费，加大“费改税”改革力度，并增强透明度，使企业了解设费根据、用途和使用情况。
三是优化税制结构。
有企业反映，流转税以货物和劳务流转额为计税基础，衔接环节极易出现重复征税，且未考虑企业是否盈利。最近两年在经营环境不佳、效益较差时期，企业税负压力反而相对加大。建议增加财产税等直接税种，相应减少流转税等间接税种，加快推广“营改增”的税制改革。
此外，62%的国有企业、52%的民营企业、54%的外资企业认为应加快金融改革，拓展渠道，扩大包括股权融资在内的直接融资比重。