莫斯科地铁的主要结构为中心向四周辐射状，其全长为313.1公里，拥有12条线路以及188个车站，其每个工作日大约能接待8-9百万人次。其所有的线路按照其开通顺序的先后获得1—11的编号，其中最重要的便是5号线——环线，它负责连接起其余绝大多数线路，其长度大约为20公里。
当地铁由周边向市中心驶去的时候，其报站音为男声，而当地铁开始驶出市中心通往郊区的时候，则为女声报站名，而在环线上，当顺时针行驶的时候，为男声报站，而逆时针的时候则为女声。
莫斯科地铁的大部分线路和车站都是在地下的，其中也有例外的，其中4号线途中的7个车站是建立在地上的，轻级捷运（Л1号）线除了与9号线交汇的转线站外全都是架空车站。3号线以及7号线分别都有一站在设立在地上；另外，还有3条线路需要通过铁桥从而穿越莫斯科河，他们分别是1号线、2号线、4号线，其中最独特的要数1号线的麻雀山站，因为该站就设立在莫斯科河的正上方的卢日尼基铁路桥上。

莫斯科市的和其他大多数国家一样，采取进站收费，一票通全程，换乘线路不另补票的方式，2007年度其费用基本为单次为17卢布，2011年升至28卢布，2013年再次升至30卢布，5次、10次、20次以及60次的地铁票则在价格上有少许优惠。同时莫斯科所有的公共交通都实行着月票的制度，即购买月票后便可不限次数在当月内随意乘坐该交通工具，地铁和地面交通的月票是分别购买且不通用的，如果想要购买通用的月票则需要付出更多的金钱。而专门的地铁月票也分为成人和学生月票两种，成人的月票价格为540卢布（限一个自然月内乘坐不超过70次），而学生月票则享有政府补贴的优惠，为350卢布（不限次）。其他特殊情况诸如一定岁数以上的老人以及军人则可以凭证件免费乘坐莫斯科的任意公共交通工具。随着莫斯科物价的增长，如今几乎每年乘坐地铁的费用都有所上涨。
在部分地铁站会有站务人员在进站处待命，不时会见到翻越栅栏意图逃票的人，但站务人员通常除了鸣哨示警以外，并不会进行追逐与强行制止。

图表上的颜色即对应地铁图上各条线路的颜色

备注
^ 虽然4号线开通于1958年，但其中部分车站本属于3号线于1935年就已开始运作。
^ 11号线于1995年开通，之前该线的3个车站建成于1961年8月，并在1995年11月前一直作为2号线的车站营运。
^ 8号线的东段与西段使用同一名字和编号但暂时互不相通，计划未来兴建中间连接段让两段合并为“加里宁-太阳线”。
连接着9号线季米里亚泽夫站与6号线国经成就展站是一条单轨路线，列车每30分钟发一班。尽管该线路隶属于莫斯科地铁旗下的莫斯科单轨运输系统，但地铁车票并不与之通用，乘客换乘这条线路时需另外收费，单程标价为26卢布。早期试营运期间的营运时间非常短（10：00-16：00），目前已延长至7:00~23：00。

1977年炸弹袭击
1977年1月8日莫斯科市总共发生了3次炸弹袭击。其中一宗亦是第一宗袭击发生于17时33分3号线的五一站至伊兹迈洛沃站隧道之间，一列载满乘客的列车中。KGB代替莫斯科警察调查事件并处决了3名亚美尼亚嫌疑犯。
1981年火警
1983年6月12日环线的十月站怀疑因为扶手电梯故障触发火警，目击者指消防员抬走了7具死者尸体。另有一宗火警发生于6号线的和平大道站，这次事故导致列车服务受阻数小时。
1982年升降机事故
1982年2月17号于8号线的航空发动机站发生致命升降机意外，由于机件故障加上是晚上繁忙时间导致升降机失控下坠，事故造成8人死亡和30多人重伤。
2004年炸弹袭击
2005年莫斯科大停电
2010年炸弹袭击
2010年3月29日，1号线的卢比扬卡和文化公园站发生恐怖袭击，导致40死及百多人受伤。俄政府决定向死伤者发放抚恤金或赔偿，金额为20万卢布（约5万港元）至 100万卢布（约26万港元）。发动袭击者怀疑为两名来自北高加索的年轻寡妇，他们的先夫都是在对俄战争中丧生的游击队员，车臣反抗军高加索前线领袖杜克·乌马罗夫事发后两天承认策动袭击。 文化公园站是红线与棕线的转运站，但在此爆炸案后，有一段时间不停靠棕线列车，仅能从红线抵达此站。 现今已恢复正常通车、转运功能。

搬运完成，收工

前排挤挤

车站名对不起来