现世利益方面：
人皆爱寿命、又怕生病，药师佛正好有这个愿力，消除众生的病苦与横死；又有护国消灾的效用；又有对治咒诅、邪鬼、蛊毒，这些恶咒术伤害众生；还有辅助众生事业圆满、居家安乐、退度灾星；又有听闻药师佛名号，不堕恶趣，纵堕恶趣，速得出离；又恶人闻名现世改邪归正，若不能改邪归正，未来也具足正见，不会在堕入邪见之中。还有大家最需要的戒律，大家都怕受戒犯戒，药师佛以愿力加持，令大家戒行不缺。纵然不小心犯了戒，也不用害怕堕入恶道，向药师佛忏悔罪得清除，戒行得圆满，等等。
末法的利益：
1、末法众生业障牵缠最为严重，又以冤业最严重。药师琉璃光佛，有解冤释结的力量，帮助我们解冤释结，令冤亲同得解脱。
2、病苦牵缠，那种苦真的是很难受，还有常见的鬼神附身病。药师琉璃光佛，以愿力治诸众生一切病苦，亦令一切鬼神开显佛性，同淂佛法利益。
3、邪师外道常会以咒术迷惑或伤害众生。药师琉璃光佛，以愿力消伏这些恶咒，令众生安稳，还令其转邪念加害，为善念互益，
4、末法众生，戒行都无，纵有戒行多有毁犯，药师琉璃光佛，以愿力救护众生令戒具足，毁坏戒行者也令其悔过，令其戒行圆满，直入成佛大戒。
5、末法众生邪见最多了。药师琉璃光佛，令他们现世舍邪归正，也令来世具足正见，并住于佛法正道，直至菩提不退转。
6、末法众生家庭事业，小人或阻碍都很多。药师琉璃光佛，以愿力辅助众生事业顺利家庭和乐，小人退避，还要以佛法大安乐，究竟安稳众生。
7、修此法门能令现生后世得不退转，速证菩提，若临命终能蒙药师佛，日光、月光诸大菩萨等接引往生净琉璃世界，永脱轮回。