药师坛城为三重檐圆坛，高三十九米，底部直径二十四米，汉白玉圜丘，蓝、黄、绿琉璃覆面，四面朱锁窗，和玺彩绘，龙凤藻井金绘。殿内四根龙井柱，高19.2米，直径1.2米，代表春夏秋冬四个季节，中十二根朱红大柱，代表十二个月，外十二根檐柱，代表十二个时辰，中外层相加为二十四根，象征着一年中二十四个节气，三层大柱合计二十八根，象征周天二十八星宿，再加上顶端八根童柱，共计三十六根，象征着三十六天罡。
药师坛城中央供奉东方三圣，是东方净琉璃世界的教主，乃是为救济一切众生的病苦，度化众生能够脱离生死的轮回之佛。
药师坛城周围墙体，供奉琉璃药师佛万尊。念佛堂两侧墙体供奉LED水晶牌位，让广大信众、社会贤达认捐供奉，使施资供奉佛像牌位者福增延寿，令入寺的香客举目皆佛像，如置身于佛围，肃然起恭敬心，莫失威仪，不使散漫，此等法缘是何等殊胜。
药师坛城地下增设地宫，建筑面积5000平方米，经大丰市民族宗教事务局批准，原“安息堂”更名为“曼陀罗”道场，地宫部分引入天圆地方用以表示佛界天堂标准的宇宙“曼陀罗”。只要在“曼陀罗”中进行法事，其中就能聚集十方三世诸圣于一处，圆轮者，为其众德。
在整体功能不受影响的前提下在殿堂内设置10万个延寿位、往生位放在朝向地藏王菩萨佛像的特制架位上，寓意万千灵魂在安息后已皈依我佛，心向我佛的诚意。
特聘采用以地宫诠释“天人合一”哲思的著名国际设计大师奚树祥先生，指导曼陀罗道场设计以及纳骨盒门套中心衬以LED灯光3D地藏王菩萨像给予加持，让先人们能安定祥和的身置俗尘不染之境地，在闪烁的星光律动之中，其丰富的色彩能彰显家族的荣耀，宗祠亲属的尊贵，使后世宗族子孙尽孝敬贤，绵延宗族一脉相承的香火，再造宗祠光辉。让广大在此安息的灵魂得到佛的安抚，也让广大缅怀亲人灵魂的信士得到心灵的慰籍，享受到佛法的浸润。