之前拜读了下某楼提供的油EVA-FANS字幕组编写的注解全书，很惊人，信息量巨大，对动画的补完完全可以媲美动画里的补完计划了……
抛掉对“内心补完”的哲学思考，整理下这个文档里所说的，单从故事层面说说EVA到底讲了什么。我个人没看完这部剧，一个有点忍不下大量的内心描白，一个部分场面太血腥……最爱13话。
至于涉及到的背景和概念是EVA自造还是现实就有不再详细区分，方便讲述。
整个剧就讲了两个字：进化。科技发展到一定水平，人类希望能够动用手段让自己成为更好的人。
而进化的手段，来自于发现不久的《里死海文书》。这是《死海全卷》之前遗失的部分，而《死海全卷》则是现代《圣经》的基础，因此《里死海文书》非常重要。而这本书更是记载了有关使徒、亚第一次冲击的事情，可以说是提供了人类进化手段的剧本。
按照这本书所说，亚当和莉莉丝是一切生物的始祖，生活在神的领域伊甸园。他们共生了16个生物，其中15个选择吃了生命之树上的生命果实，成为拥有强大力量和不死生命的种族，他们是使徒；剩下一个选择了智慧果实，结果因为其AT力场弱到无法保持其外形，分裂为无数个体，就是现在的人类。而AT力场则成文了人与人之间的“心之壁”，阻碍了人们的相互理解。
选择了智慧果实的人类明辨事理，而上帝害怕他们再获得生命果实，成为神一样的存在，于是他们被赶出伊甸园，发配到地球，远离结着生命果实的生命之树。而使徒，也正是生命之树的守护天使。
这本书说，人类重新回到伊甸园的方法是像耶稣一样接受审判，即在生命之树上被朗基努斯之枪刺中，当血流到大地上的时候一切罪责都会被原谅，人类就会回归伊甸园。而这样的代价就是，所有的人都要死。（即引发第三次冲击，洗涤人的罪责，人们不再有心之壁，因此就失去形体，成为一个完整的神一样的存在……第一次冲击就是诺亚方舟那次的洪水，洗掉了所有不遵守上帝的道德规则的“坏人”；第二次是在南极的操作失误导致）
以上是末后组织seele的人类补完剧本，是以“认罪”的态度请求神的原谅，从而回到神的领域；而在碇司令领导下的属于seele的执行组织的NERV，一边假意按照seele的剧本行事，一边暗中执行自己的补完计划。
NERV的剧本是：人类充分发挥科技的能力（也就是智慧果实带来的力量），强行抢夺生命果实，同时拥有智慧果实和生命果实，从而成为神一样的存在。NERV的态度，是“逆神”。
而按照《里死海文书》，出现生命果实的生命之树的前提是，打倒所有使徒。为了达到这个两方都毕竟的步骤，NERV和seele在前期是可以合作的。EVA在两者的严重都是非常重要的工具和角色。不同的是，在NERV的剧本中，它是以科技的能力所制造的终极兵器，在获得了生命果实之后，它就成为“新人类”；而在seele的剧本中，EVA是代表人类接受审判的人，是引发第三次冲击的工具。
然后就是各种好看的（以及血腥的）战斗场面，更重要的是“内心补完”，即在心理上成为更好的人，而不仅仅是获得神的力量而已……
超级讨厌真嗣的个性，与三号机作战的时候一味逃避结果在dummy system的操纵下东治失去了左腿；剧场版明日香与量产EVA战斗的时候也只是一味坚持“不驾驶EVA”，然后二号机被虐杀竟然说“都是明日香的错，不驾驶EVA就好了”……简直就是“何不食肉”的思维模式。在他自己有能力做出改变的时候，因为他自已厌恶这种事情而回避，然后在别人打算不依赖他而作这件事的时候，又反过来埋怨别人残忍……事情永远在那里摆着是客观事实，不是靠所有人都逃避就能解决的，看不下去的正确做法应该是努力推动它往自己期望的情况发展，而不是坐着躲避。

EVA的动画剧情起源于希伯来圣经。这个世界上呢有十八名使徒，第一名为亚当，第二名为莉莉丝，然后三至十七就是动画中出现过的BOSS，然后第十八是人类（Lilin）。
其中，亚当被看作为使徒的始祖，隐藏在白之月中，莉莉丝是人类的始祖，隐藏在黑之月中。
按照时间顺序这个剧情应该是这样的。
不知道什么时候，第一始祖民族出现，他们在名为“月”的载体中放入了生命的种子。
6500万年前，黑之月从月到达地球时引发了第一次冲击，白之月到达地球并没有引发冲击而是隐藏在了南极中。
中世纪，宗教团体Seele（德语，灵魂）成立，并逐步扩张势力，在20世纪触手到达全世界，成为控制人力的背后势力。
2000年，人类发现了南极中的白之月，研究亚当的时候唤醒了亚当，亚当释放其力量造成第二次冲击，南极大爆炸，海平面上升，地轴偏转，四季变化，人类半数死亡，地面适合人类生存的地方急剧缩小，人类转移到地下。
2001年，碇真嗣、明日香出生。
2003年，人工进化研究所成立，开始对南极事故（亚当）的研究。实际上则是Seele开始三大计划，即人类补完计划、E计划和adam计划。
2004年，碇唯和明日香的母亲在EVA试验中严重受创，碇唯死亡，明日香母亲神经错乱。实际上是，碇唯的灵魂融于一号机，明日香母亲的部分灵魂融入二号机。
2008年，赤木律子跟随母亲赤木尚子进入E计划，开始开发电脑MAGI。
2010年，智能电脑MAGI开发完成，赤木尚子死亡，实际上灵魂融入MAGI。人工进化研究所改编成为NERV（神经）。
2015年，使徒出现，马尔杜克机关成立，开始选拔EVA的驾驶员。实际上是真嗣所在那个班。
=================================================================
大概的背景就是这些，开始介绍一下，呃，剧情。
首先来讲，亚当是生命的始祖，而莉莉丝是人类的始祖，三至十六使徒都是亚当的孩子，长期沉睡在地球中。使徒中，人类继承了智慧果实而使徒继承了生命果实，生命果实让使徒的A.T力场比较强大，达到了能影响物理现实的地步，同时保持使徒形态，人类的智慧果实获得了异常发达的智慧，但A.T力场只能影响思想交流，人类无法保持初始的使徒形态，被分为了现在这个样子，而A.T力场形成了心之壁是原本使一体的思想变成了无数独立思想。
人类补完计划是整个动画的核心，源于Seele。Seele想获得人类不灭，想让人类归于统一的思想，那么诱发的条件是触发第三次冲击，毁灭全人类的肉体归于LCL溶液中，然后自己成为第三次冲击的引导者。
第三次冲击，触发条件是使徒的灵魂和亚当的肉体的结合，这里有三种不同的使徒灵魂：绫波丽（受控制的莉莉丝灵魂）、使徒和渚薰（受控制的亚当灵魂）
（后注： 贴吧“漂流的瓶子”所列条件如下：“1.使徒接触完整ADAM；2.量产机型与初号机举行处死仪式；3.完整的ADAM与完整的LILITH禁忌融合；4.完整的LILITH与量产系 列利用朗枪举行的仪式；5.人造使徒接触完整ADAM，其实这个也可以归类在1里面，不过就特殊性而言，将其分了出来。”我认为处死仪式是必须的，但他不是触发第三次冲击的关键）
因此他们制定了三大计划，E计划创造了MAGI和EVA，Adam计划创造了渚薰。渚薰的灵魂是adam的灵魂，肉体是个人类的肉体，因此他是个人造使徒。并且，他受到了Seele的控制，无法违背Seele的命令。
Seele成立NERV的目的是完成人类补完计划，但是，NERV的司令碇源堂拥有他自己的计划，并且有两件事一直瞒着Seele，一是，他偷换了亚当的肉体，囚禁在最终教条区的莉莉丝肉体被误认为亚当的肉体；二是，他偷偷复制了Adam计划，创造了绫波丽，人类的肉体（碇唯）+莉莉丝的灵魂。但绫波丽不是使徒，因为使徒是亚当的后代，拥有亚当的灵魂。
Seele的人类补完计划是，用渚薰碰触亚当的肉体，引发第三次冲击；使徒的计划是，自己去碰触亚当引发第三次冲击毁灭罪恶的人类，因为他们是亚当的后代，可以看作拥有亚当的灵魂；碇源堂的计划是，让绫波丽触碰亚当的肉体自己成为神见到碇唯；最后是碇唯的计划，让自己的儿子碇真嗣成为神“活下来”。

然后就是这四个计划的博弈，在第十七使徒渚薰“自由”出现前，Seele和NERV是表面上下级实际为合作的关系，因为他们都要阻止使徒的计划，不能让使徒的灵魂碰到亚当的肉体。但是，碇源堂让使徒和Seele都误会了一件事：NERV里面不是亚当的肉体，而是莉莉丝的。真正的亚当肉体应该已经被微缩成胚胎被碇源堂吞下（某集加持良治交给他的东西）（加持良治是Nerv派到Seele的间谍，又被Seele信任派到NERV当间谍。。。也是碇源堂能瞒天过海的关键）
但是这里面有个关键，那就是EVA。EVA名义上被叫做兵器，实际上是人类补完计划的一部分、亚当肉体的复制，但不完整，没有使徒的关键S2机关，无法自己产生能量。而且，要防止使徒碰触到亚当的肉体，因此用装甲把他们包了起来。EVA的装甲不是来保护他们的，而是要防止肉体的暴露阻止使徒的直接接触，并且限制EVA肉体的力量，这一点光从装甲的名字就可以看出来：拘束器。（以下为@林苍剑 补充后答案）初号机是莉莉丝的复制，有别于其他机体。
在初号机暴走的时刻，初号机吞噬了十三使徒小力的S2机关，成为了完整的使徒肉体，所以他才是唯一能触发第三次冲击的关键，但当时只有碇源堂知道。Seele怕出事不敢用初号机试验，所以第一选择仍然是他们想象中被囚禁在最终教条区的亚当肉体。
当十七使徒渚薰到达最终教条区时，发现亚当的肉体被替换成了莉莉丝的肉体，而亚当的肉体不知所踪。这时候Seele才真正意识到碇源堂背叛了他们（之前只是防备），因此在air真心为你这部剧场版，才看到了Seele活捉初号机、抓捕碇源堂的行为，因为他们不知道亚当的肉体哪儿去了，要问碇源堂；既然找不到亚当的肉体就要把控初号机。
这时候碇源堂选择了把亚当的肉体交给绫波丽，莉莉丝的灵魂和亚当的肉体结合，但可惜的是，绫波丽选择了碇真嗣，于是接着绫波丽回归莉莉丝肉体并且和初号机结合，触发第三次冲击，而碇真嗣成为神。

我看的时候都是懵懂的。。。。。就觉得机甲很帅 。。。。多看几遍，，研究研究