1.溶解氧
水体溶解氧的高低，会影响到好氧菌生长速度和氧化分解有机质的速率。目前芽孢杆菌为好氧菌，硝化细菌为严格好氧菌，使用含有这类活菌的产品，一定要保持水体足够的溶解氧，才能维持细菌快速繁殖和对污染物的有效分解。
池塘底部低溶氧会影响生物改底的使用效果，大多数养殖户喜欢使用颗粒型生物改底，如底巧。他们普遍认为既然是改底，当然要沉到池底才能更好的发挥作用。但池塘底部是污染最严重的区域，尤其是养殖的中后期，底部积累的好氧因子会使底部溶解氧普遍偏低，如果生物底改中没有耐低氧菌株，那么这些细菌在低氧的环境中生长繁殖并不理想，虽然直接到了底部，但大部分细菌体休眠或没有繁殖，甚至死亡，所以在使用生物底改时推荐配合增氧剂一起使用，如底生氧，可以通过增加底部溶氧来促进生物底改的效果。