从2004年起，重组中的意大利航空集团分为两个部门运营：AZ Fly 运作所有航班业务、AZ Servizi 承担所有地勤任务。
意大利航空公司在2008年过去的16年中仅有4年实现盈利。居高不下的劳工成本、低成本航空运营商的增加以及管理上的低效是导致该航空公司经营不善的主要原因。加上意航劳资纠纷不断、管理层频繁更迭、服务质量下滑、飞机误点、旅客行李丢失严重，意大利航空的服务一直为人垢病。另外，意航的劳动效率不高。有数据显示，意航飞行员平均每年的飞行时间远低于法航、英航飞行员，而意航职工的劳动开支成本却比欧洲其他航空公司平均值高，公司的竞争力因而大受影响。意航在国际航线和欧洲内陆航线的盈利一直较低。意大利航空公司自2002年起年年亏损。意航近年已须屡靠变卖资产维持。