石器时代《精灵的召唤》除了在玩法外，另外就是针对石器时代以往众多版本间的故事加以串连和交代，并且贯穿整个伊甸大陆，在故事性上以伊甸大陆主线开始到破坏让魔物入侵的魔界之门，整个描绘出原始世界的壮阔和气息，在《精灵的召唤》中原始人们会和众精灵有非常密集的互动，包含宠物2转之谜，以及最终极的人物六转之谜都需要玩家们抽丝剥茧的一一找寻答案。而《精灵的召唤》也把经由宠物2转的机制，让石器时代原始的一代宠物有进化的能力强到足以抗衡二、三代宠。而宠物融合和职业技能，也将决定是否能将来自魔界的魔物击退的要素。