1647年1月，毕方济奉命前往澳门借兵购炮，澳门葡人很快便组建了一支配备6门大炮的火枪队，由尼古拉·费雷拉担任统帅，以耶稣会士瞿纱微为随军翻译。 当年2月，这支葡萄牙雇佣兵抵达桂林，正赶上清军李成栋部突袭广西，永历小朝廷照例一逃了之，只留下瞿式耜等文官困守桂林。3月11日，几百名清军一路无阻地杀进桂林北门，幸亏警惕性很强的葡萄牙雇佣军在城头用火绳枪和大炮将其全歼。5月25日，清军主力由湖南再次强攻桂林，瞿式耜指挥费雷拉和其他明军将领分守各城门，一向骄横的清军骑兵没想到葡萄牙人的大炮打得那么远，士气大挫。葡萄牙火枪队趁势杀到城外，他们摆出欧洲流行的“摩里斯步兵方阵”，把清军骑兵打得落花流水。
此战让葡萄牙雇佣军名气大盛，耶稣会士瞿纱微也因此成为皇家御用神甫，他一口气把上至皇后，下至太监宫女的人都变成教徒，比如永历正宫皇后王氏的教名为“安娜”，皇子朱慈恒的教名为“康斯坦丁”等，永历皇帝因不愿放弃三宫六院的“幸福生活”，而没有被瞿纱微施洗。1648年10月17日，太监庞天寿入澳，各炮台鸣炮致敬，当地的圣保罗教堂为南明王室举行隆重的弥撒，澳门总督还赠送火枪100支，作为给永历政府的礼物。 关于这支葡萄牙雇佣军的结局，中外史料都没有明确的记录，只知道这支打着西方战旗的部队隶属明朝总兵官焦琏节制，1650年焦琏被部将陈邦傅诱杀，焦琏部明军覆灭了，传教士瞿纱微随永历帝西奔到贵州，因所乘之舟速度太慢，而被清兵追及杀害。所有和葡萄牙雇佣军有关的人物都死了，这支部队也消失在历史的尘埃中。