上海菩佑科技开发的软件也很专一，菩佑寺院管理软件包括信众管理，佛事管理，法会管理，牌位管理，佛像管理，捐赠管理，皈依弟子管理，常住挂单僧人管理，职工管理，义工管理，档案管理，财务钱流管理，住宿/客房管理， 功德会会员管理，慈善管理，素斋馆管理，牌位/佛像智能化管理，牌位/佛像点灯寻灯管理，网站信息化，库房管理和法务流通处管理等并成功应用于三十多家寺庙中，在此期望能让更多寺院的事务活动在寺院事务管理委员会的领导下，能有更加合理、简单便捷、快速高效的管理。同时也期望能让寺院本身注入更新的生命力与活力，使其能够在当今科技发达的信息化时代里，继续扮演着民间民俗文化与社会道德秩序的重要角色。