在这里明确两个概念，亲子鉴定医学检验所和亲子鉴定司法鉴定所。
亲子鉴定医学检验所是指具有国家卫计委颁发的亲子鉴定证书的检测机构，是有做个人隐私鉴定的资质的，也就是说这种的鉴定只供个人隐私参考，不作为法律证据使用。
亲子鉴定司法鉴定所是指具有司法鉴定资质的检验所，他们是专注于做司法鉴定的，其鉴定结果可以作为司法程序的证据存在的，比如，遗失孩子上户口，重大事故后DNA鉴定等都是由他们进行检测的，医学检验所的结果不具备法律效应。
所以您只是单纯的个人想知道腹中胎儿的亲子关系，大可放心找医学鉴定所，都是国家证书的，安全有保障，但是如果是上户口这些走司法程序的则需要找司法鉴定机构。
至于平潭万基医学检验所合法么??他们能做无创产前亲子鉴定吗? 可以到卫计委官方网站查询。我这边的回答是：平潭万基医学检验所合法。他们有资质进行无创产前亲子鉴定。