有关1940年细菌战情况的井本日记（摘自一审起诉书）
　　以下引的1940年的井本日记证明了日军对衢州和宁波进行过细菌战。
　　1、1940年6月5日的井本日记
　　下述6月5日的日记记载了支那派遣军参谋井本与参谋本部作战课的荒尾兴功（中佐，当时的官衔，以下同样），增田知贞（中佐）商量有关浙江省细菌战的内容。
　　1、时间：暂定（7月中） 解决□□问题
　　2、机场：句阳机场
　　3、目标：浙江沿线城市
　　4、实行部队的指挥 总司令部直辖（石井大佐负责）（略）
　　５、高度约四千以上
　　６、种类：散布跳蚤
　　[1940年6月5日“井本日记”第7卷]
　　上述内容与第二章所述相同。另外可知，当初江苏省的句容（南京的东面）被预定为机场。
　　2、上述1以下的井本日记中有如下一些关于细菌战的记载（“ ”内为原文）。
　　六月二十八日。井本“为了与中央联系“木”等事宜，紧急决定立即去东京”，从南京出发来到东京。（“井本日记”第7卷。下同）
　　七月二日。井本在东京的“军医学校与石井大佐及下属为确认有关决定事项，又一次进行了商谈”。
　　7月21日。井本“上午在石井部队商谈“木”的事情后”，接到“东京下达命令时立即参与作战的航空参谋立即上京为主要内容的电报”，“下决心侦察杭州”。
　　7月22日。井本“上午飞杭州侦察各要件”、“决定使用杭州市苋桥的旧中央航空学校”。

　5、1940年9月18日的井本日记
　　以下9月18日的记载了井本与奈良部队之间确认了的细菌战的具体实行计划的内容。
　　18/9（9月18日）星期三

二、与奈良部队的联络内容
　　1、拖延开始细菌战的原因
　　2、决定弹药空运与陆上输送并行
　　3、福岛雇用人员的战死情况
　　4、一天生产霍乱菌10千克、伤寒菌10千克以上
　　5、目标可定为宁波（或其附近地区，一平方米公里用1.5公斤的细菌）。
　　金华、玉山一平方米公里使用二千克细菌（其附近地区一平方米公里使用 0.7—0.8千克细菌）

3、1940年8月16日的井本日记
　　以下8月16日的日记以“在杭州连络”为题，记载了井本到杭州市苋桥的旧中央航空学校，向作为细菌战的实战部队的奈良部队传达支那派遣军总司令部的命令时的连络内容。
　　1、传达命令
　　6、经费的出处（在总司令部研究是从哈尔滨还是从南京筹措经费）
　　12、从空中对目标进行拍照
　　13、申请消毒药
　　15、驻军要地地志（到攻击目标之前）
　　17、○弹 H15 
　　[1940年8月16日“井本日记”第8卷]
　　如上所记，所谓的支那派遣总司令部传达的命令是对在杭州的石井部队而言的。其内容是关于细菌战的具体攻击目标的空中摄像，攻击目标的地志等的搜索以及细菌战弹药、消毒液的准备等的作战指令。而其中所述的[ 15 H ]，则是15发的意思。
　　4、1940年9月10日的井本日记
　　以下的9月10的日记，记载了井本从奈良部队的大四澄（中佐）和增田美保（大尉）处接到了关于攻击目标和运送细菌的报告的情况。
　　10/9 （9月10日）
　　一、与奈良部队的太田（大田。译者注）中佐和增田大尉联系
　　1、定于9/10搜索目标，把宁波和衡州作为目标是妥当的
　　金华：空中摄像城市
　　2、10/9第一次弹药输送迟到，预定在几天内到达，第一次 C 改为 T
　　[1940年8月16日“井本日记”第8卷]
　　如上所述，大田澄和增田美保根据空中摄像的搜索结果，向井本报告了将宁波和衡县作为攻击目标是适当的，并提出以金华作为候补。而且，将第一次细菌战输送的弹药由当初预定的“C”（霍乱菌）改为“T”（伤寒菌）。

山本吉郎（关东军参谋）的意见。
　　1、有两种使用弹药的方法，一种是大范围使用稀释半金属弹药，另一种是少次数使用高浓度弹药，选定温州为实施后项方法的地区（台州、温州、丽水）。
　　2、为能决定使用下雨式投放弹药而使用降落伞的计划 宁波的海上方案
　　3、借用一架航空摄像机
　　4、关于使用苋桥机场的事情，应避免其它部队该飞机场，还有其它联系的事宜
　　5、递交地图的事情
　　6、与战术有关的事项、关于其用法的事情 [1940年9月18日“井本日记”第9卷]
　　如上所记，井本与奈良部队之间确认下来的有关细菌战具体实行计划的内容为：在已作为攻击目标的宁波、金华的基础上，再加上玉山、温州、台州等地区；在宁波一公里见方的地区上使用1.5千克的细菌等，明确了各攻击目标的具体细菌使用量等。