执业药师是资格证书，初级药师是职称类的考试。两个都是全国统一考试。
执业药师属于药监系统和人事考试中心负责，执业药师主要是在药品生产企业、批发企业、零售企业等单位从业。执业药师主要时在药店等药品经营单位工作，一般不能作为应聘医院的依据。
初级药师考试是卫生部门组织的药学职称考试，主要在医院药房等医疗单位从业，包括药士、药师、主管药师。 卫生系统的需要参加初级药师考试。