输尿管结石的危害主要是结石停留在局部，造成坎墩引发输尿管的梗阻，肾脏的积水甚至肾功能的损害，长期得不到有效的治疗的话，它还会造成重度的肾积水，肾脏的丢失。结石的梗阻通常是不完全性梗阻，若双侧输尿管或尿道梗阻则可出现尿闭，严重者发展为尿毒症。