杭绍台高铁温岭至玉环段采用城际动车组列车与中长途跨线动车组列车共线运行的运输组织模式，列车均采用8辆编组。
温岭动车上、下行走行线和杭绍台场至甬台温上行联络线开行列车包括8辆短编组和16辆长编组。