郑成功早年在金厦建立了抗清基地，可是金厦两岛毕竟面积狭小、人多地狭、粮食不能自给且距离大陆太近。
而明朝时的海南岛不同，毕竟有华夏先民两千年的开发和移民，明代海南设琼州府，领儋、万、崖三州10个县，海南岛土地肥沃，地广人稀，且是一府之地，原住人口远超金厦两岛（明永乐十年，琼州府也就是海南岛有337,479人，明末时起码有六七十万人口）更何况琼州海峡更宽更安全！
为什么国姓爷不在海南岛建立抗清根据地呢？从国姓爷起兵到东渡台湾，郑成功都没有考虑过占领海南岛作为根据地之一，而且也没有其他的海上抗清力量(比如南明凌海将军陈奇策、高廉雷三州总兵陈上川等)考虑过将海南岛作为抗清基地，这是为什么？