非传染性病因
环境性腹泻
秋冬季气温低，仔猪在应激状态下易产生腹泻综合症，如气温骤变、阴雨不断、潮湿寒冷、通风卫生以及环境突然变化致使机体出现应激性反应，都成为猪腹泻发生的诱因。低温状态下，育成猪、中大猪均可产生不良应激反应，营养代谢发生在机体内部，造成机能紊乱，而外部出现腹泻或便秘等病理症状。养殖场工作人员无法有效执行兽医卫生制度管理及生物安全防范措施，致使有害气体、病原微生物含量超标，导致消化道疾病。
营养性腹泻
长期缺乏某些营养物质或不当搭配会导致猪的胃肠道黏膜发育不良及异变(发炎、坏死及脱落)；饲料的营养物质不足，影响了母乳的数量和质量、如母乳中VB不足或蛋白含量、脂类含量超标时，可使胃肠消化机能障碍，引起消化不良导致腹泻；经过消化酶作用但未完全分解的蛋白质分子进入大肠内发酵,其发酵的最后产物包括有毒胺类,这些物质会造成消化道的发炎现象,减少肠道二次吸收作用并继发二次感染；给料不均，暴饮暴食造成猪出现即时性腹泻；误食有毒物质以及酸、碱、砷等化学药物也可导致腹泻。
猪消化道疾病的防治
细菌性腹泻的防治
由于近些年抗生素的滥用，细菌的耐药性逐渐增强，在治疗细菌性腹泻时应选取相对敏感的药物，并且使用的剂量要足够大，治疗的疗程要足够长。可以选择磺胺类或抗生素进行治疗，如磺胺二甲基嘧啶、磺胺脒、庆大霉素、氟苯尼考等，可采用的方法有口服法、注射法。治疗要坚持母仔兼治的原则，即同一窝中有一头发病，全窝仔猪皆治。在采取用药的同时要注意改善环境和卫生状况，增强营养，促进病猪康复。
病毒性腹泻的防治
由于病毒性腹泻没有用于治疗的特效药，所以只能用疫苗免疫来预防。免疫接种是控制传染病发生的重要措施，目前用于治疗病毒性腹泻的疫苗主要有猪传染性胃肠炎、猪流行性腹泻二联灭活苗，猪传染性胃肠炎、猪流行性腹泻二联活疫苗，猪传染性胃肠炎、猪流行性腹泻、轮状病毒三联活疫苗。由于活疫苗既能刺激机体产生体液免疫又可刺激机体产生细胞免疫，而且可以更快速的产生抗体，因此使用活疫苗效果好于灭活苗。疫苗的使用和保存应严格按说明书进行。现实应用上可结合当地疫病流行情况、猪场的实际情况，制定相应的免疫措施。同时要根据机体的健康状况、幼猪体内母源抗体的情况而采取科学的免疫程序。有条件的可以进行抗体监测，无条件的可以根据相同条件下猪场的成功经验确定免疫程序。
寄生虫性腹泻的防治
由于球虫易产生耐药性的特点，治疗或预防时要有计划交替或联合应用抗球虫药物。治疗药物多为口服磺胺类、球虫清或地克珠利。为达到最佳治疗效果，必须早期治疗。线虫治疗和预防药物有左旋咪唑、丙硫咪唑、伊维菌素等。弓形虫治疗采用磺胺类药物，如五甲氧磺胺嘧啶、六甲氧磺胺嘧啶、复方磺胺甲基异唑等。为起到预防效果，需保证猪场及周边环境卫生良好，严禁饲养猫，谨防卵囊污染饲料和饮水，猪喂养禁止使用生肉屑，泔水应熟饲。吸虫治疗药物有吡喹酮、硫双二氯酚、硝硫氰胺等。
综合防控
加强营养：供给猪群全价饲料，确保猪群营养供给平衡，严防维生素及微量元素等物质的缺乏，通过提升猪群饲料质量水平，增强猪体抵抗力，依此来抵御病原体，特别是抗御肠道病原体的防御力，减少猪肠道疾病的暴发的可能。供给充足的干净卫生的洁净水.严防猪只饮食污染的冰凉的水源。
保温：温度适宜不但能保证仔猪获得较好的抵抗力，又能防止初生仔猪因怕冷紧挨母猪而被压死。通常初生仔猪1-3日龄温度应达到30-35℃，4-7日龄27-30℃，8-30日龄22-26℃。仔猪保温的方法主要有：保温箱、保温灯、增加取暖设备等方法，关好门窗，阻止缝隙，防止外来冷风进入猪舍，寒冷季节尽量不用水冲猪圈。
消毒：消毒应根据病原体的种类及特点而选择适当的消毒药及消毒方法，带猪消毒可选用酸类和醛类消毒剂，空舍消毒可选用碱类消毒剂，而且尽量选取高效的消毒剂以达到更好的消毒效果，并保证足够的消毒剂量。母猪产房要彻底清扫、冲洗、消毒，产房门口要设立消毒池、消毒室，进出的车辆和人员都要进行严格的消毒。平时要建立定期的消毒制度。建议每星期最好消毒1-2次，现消毒现配消毒剂，对猪实施喷洒式消毒。这种做法可起到疾病的抑制和扩散作用，达到疾病的感染率降低的目的。猪场一旦发现传染病，应对猪舍和用具做到每周消毒1次，病情严重的可以每间隔1天消毒1次。消毒时，需要先清洁干净圈舍中的粪尿和污物，再把表层土壤铲掉，最后使用消毒液消毒。
隔离：严禁引进发病猪场的仔猪和种猪，养猪场可以采用的最好方法是自繁自养。确定需要外部引进仔猪，一定要隔离观察30天，问题一旦出现，及时解决，防止疾病扩散传播。平时饲养人员就要做好猪疾病的预防与检查工作，一旦发现疫情要及时隔离，并积极治疗，防止疫情蔓延。
猪场对与猪消化道疾病，一定以预防为主，采取免疫接种和药物治疗的同时，要做到科学的，规范的饲养管理，做好生物安全措施。