有很多原因。
曾国藩是一传统文人，不是军头，本身忠君思想浓厚，自我道德要求高。再说曾氏的身体不好，缺乏领兵打仗的精力，也缺乏指挥作战的才能。从主观条件上就不适合当叛乱首领。
湘军缺乏骑兵，而北方八旗的骑兵加在任何一支军队上都如虎添翼。甚至左宗棠西征时金顺率领的八旗军还是西征三大主力之一。
破天京之后湘军已经解散了大半，战争中发了财的官兵都去当官或者当地主了，没人想当军阀。那时社会的价值观还没变成清末那么尚武，还是崇尚仕途，不像清末科举都废了。加上清廷注意拉拢，封官许愿，所以湘淮集团没有形成割据一方的军阀势力。
再说那时候湘军经过久战已经疲惫不堪，无论战法武器还是士气都不是后起之秀淮军的对手。除了湘军淮军以外其实各地相似的勇营还有很多。清廷以正统相号召不愁拉不到抗衡的军力。
清廷对湘淮系的官员采取类似多封众建分化瓦解的策略，就连曾国藩曾经亲自提拔保举的很多人都自立门户了，甚至像左宗棠和沈葆桢这些人与曾氏的关系都恶化了。
清廷注意保持对官员的任命权，坚持不懈地要求厘金核查和田赋上缴。平太平天国的军费要几个省一起协作征集，还嫌不够，清廷只要把住一两个省的督抚任命就等于卡住了军队的脖子。而且清廷还有关税的优势。因此清廷作为金主的实力远远超过任何一个督抚。
湘军作为一支客场作战的雇佣军，对战区破坏很大，民怨沸腾，就连当地官员都不欢迎，一旦作战离开家乡首先就要被当地团练死磕。
英国人此时支持稳定的大清使国际局势不利于叛乱者。洋人的加成无法估量。
