官方在 2014 年開設了一個「神奇寶貝恐怖實錄」的頁面，印象中應該是萬聖節時公開的(?)
裡面分別對《神奇寶貝 紅 / 綠》《神奇寶貝 珍珠 / 鑽石》《神奇寶貝 黑 / 白》《神奇寶貝 X / Y》
知名的都市傳說或靈異事件進行解釋，雖然不少問題都只含糊帶過......。

#1　[ DP 森之洋館 ]
森之洋館是位於神奧地方的百代森林出口附近的一座無人建築，也是第四世代在玩家間非常有名的鬼屋。達成一些相關條件後，在晚上八點後於洋館內察看電視可以找到洛托姆。不過這裡其實隱藏著不為人知的秘密……。
動畫圖鑑：洛托姆，電系及幽靈系神奇寶貝。是電離子形成的神奇寶貝，像電氣一樣的身體可以進入某些家電用品中。
森之洋館都市傳說
在一棟洋館裡，住著一個老人、雙胞胎孫子和孫女與兩隻神奇寶貝，他們的生活過的非常幸福，直到來了一位青年...他是一位企業家，是老人的弟子。
為了受到老師的教導，他決定住上幾年。雙胞胎馬上就喜歡上了他，加上他很會畫畫，雙胞胎也開始向他學習
不過沒過幾個月，那個青年向女孩下了手...對正處於兒童期的女孩下了手...他決定殺掉少女以外的人。
實際上，他只想得到少女珍貴的神奇寶貝和金庫的密碼。
生活並沒有因為青年而被擾亂...。
男孩知道，自己的姐姐飽受委屈，可是自己什麼也沒做到...
一天晚上，在閃電雷鳴的暴雨天，青年終於下了手...他在男孩和老人的飯菜下了毒。
但這一幕被女孩看見了。
於是女孩趁青年不注意的時候，將有毒的飯菜和沒毒的換了過來...並將有毒的擺到了自己和青年的位置。
青年一直在等待這個時刻，馬上就要得到一切了，他已經迫不及待了。
跟以往一樣的食堂，少年見少女一口飯都不吃，男孩和老人卻吃的津津有味。
突然,青年自己出現了頭痛和嘔吐等症狀。
青年察覺自己中了毒，急忙跑到廚房使用了解毒劑，扔進了垃圾桶「失敗了...」
青年低聲說道...，這時老人走了進來，並問他發生了什麼事。
青年知道這裡是孩子看不到的地方，於是拿起了菜刀...
青年回到雙胞胎面前，身上沾滿了鮮血。
雙胞胎頓時領悟到自己的爺爺已經不在人世。男孩因為恐懼無法動彈，而女孩則抱住男孩。
青年猙獰地看著雙胞胎，他分不清楚哪個是男的還是女的，便決定滅口。
少女到青年面前向他挑釁，好讓男孩逃走。男孩拋棄了女孩，跑出了食堂。
館內響起了女孩悽慘的叫聲。
青年知道殺掉的是女孩，便去追男孩，但是外面下著大雨「逃走了嗎？算了...」青年藏好老人和少女的屍體，然後搬走了樓梯前的雕像...
－ 20 年後 －
在 212 號道路的別墅裡有一位保安，不管發生什麼也不會讓主角去碰那個銅像。
只有深夜他去洋館為了祭祀爺爺和姐姐放一個羊羹時，我們才可以去碰。
那位男孩並沒有忘記...
眼前的老闆就是奪走一切的殺人兇手，他一直在找機會報仇雪恨...
　　至於那兩隻神奇寶貝，當看到少女被殺害時，害怕的藏了起來，一個藏在電視裡，一個藏在男孩肖像裡監視著來到這裡的不速之客。也有人說晚上 8 點藏在電視裡的神奇寶貝因為想念女孩而哭泣...。

在玩家抵達這座洋館後，將隨機性看到似乎是一個小女孩和管家的幽靈，分別出現在 2F 的臥室以及 1F 的餐廳。
當主角進入卧室時隔壁房間有時會出現「幽靈」小女孩。
她「走」出門外，從來沒有真正看到對方。
至於管家出現在餐桌的另一邊，坐在餐廳。
主角向前走，他開始移動並離開遊戲視窗，而他從來沒有出現在餐桌另一邊。
不同與小女孩的地方是，管家不是步行離開的。相反，他似乎是「漂浮」在地面上。
更令人感到驚悚的是，洋館中 2F 房裡的一幅紫色畫像，會冒出紅色的眼睛並且一直盯著主角，而隨著玩家的不同位置畫中眼睛也會跟著改變，但玩家接近此幅畫像時紅眼即立刻消失。
在洋館中玩家可於圾垃桶取得解毒劑、宴會廳取得神奇糖果及大珍珠、房裡取得的森之羊羹等道具，其中森之羊羹附帶的洋館鬧鬼的說明中提到他們都是「幽靈」。
甚至在小女孩所出現的房裡還能取得招式機「替身」，不免會讓人聯想到替死鬼…。

順帶一提，在白金版中有一本筆記可以閱讀。
它上面寫著：「這是一本殘舊的書。上面有些潦草的字跡……」「那種不明的……居然拿著……」
「剩下的就是一片空白。」讓人看了不寒而慄。
其實當玩家第一次來到森之洋館時，會在外面遇見企圖不明的百代市的道館館主「菜種」
因為該處僅有他獨自一人，遊戲中玩家和他對話會得知他因為害怕幽靈而拒絕進入森之洋館內
且令人懷疑的是菜種隨後會慌張的回到城市。
此外玩家要在獲得他的徽章後才能使用「一字斬」進入洋館內。
也因此有另種說法是「菜種」其實是整起事件的兇手？
提及第四世代神奧地區，其實是以現實世界的北海道和國後島為原型而構出的虛擬地區
若比照兩者地圖會發現，森林洋館的位置其實正好在松扇園上。
那裡曾發生悽慘的殺人事件…手法是毒殺…最後犯人上吊自殺……，整個內容似乎就是在映射這起殺人事件。

#2　[ XY 電梯幽靈 ]
作為第六世代的《神奇寶貝 X / Y》剛推出時，不少玩家破關後即發現這代留下了不少的謎題。
而最讓玩家最感興趣的就是每代都會隱藏的靈異故事，當然這代也不例外。
當玩家來到密阿雷市的北側一棟大樓，並且搭電梯來到二樓時，將觸發一段靈異事件。
首先玩家一開始到達二樓並走出電梯門後，畫面會開始閃爍，隨後遊戲背景音樂也跟著中止。
這時在玩家後方會突然出現一名女幽靈，留下一句「不對...不是你」後往前方飄移並消失。
但背景音樂再度恢復且玩家能行動時，才發現這層樓根本沒有任何的人，就連剛剛的女幽靈也瞬間消失了......。
該大樓一樓和三樓分別為正常的大廳與格鬥教室，唯獨二樓空無一人。
當玩家和一樓櫃檯的服務員對話，也只能得到「我剛來到這裡，還不了解這棟大樓的事。」這樣的回答。
另外，玩家進入密阿雷市中的一棟大酒店的 4 樓的右側房間，會遇見一名在大樓所遇到的幽靈相同角色模組的靈異狂。
當玩家和他說話時，他會告訴玩家「...別和我說話...不然我聽不到電梯的聲音。」
令人毛骨悚然的話語，讓人不禁認為她是否與玩家在大樓裡遇到的幽靈為同一人
並且是否在房間等待著有人搭乘電梯時，趁機跑到玩家後方確認身分，才會說出「不對...不是你」暗示著再找某人的台詞.......

值得一提的是，靠近該大樓的第 14 號道路中的一棟「恐怖之家」，初次到這裡時裡面會有一個爺爺和玩家分享一段鬼故事，雖然他所提到的幽靈不確定是否和這起事件有所關連，但不禁讓人產生聯想。
且當他說完鬼故事後，還會和玩家索取 100, 500, 或 1000 元的小費，老爺爺甚至還說了「如果你拒絕，你會遭遇很可怕的事情。」

#3　[ RG 拉達之死 ]
在枯葉市的豪華客船聖安奴號上你打敗了你的勁敵，之後你就再也沒有見過他
直到一日你踏入了紫苑鎮，進入了神奇寶貝塔，那有許多死去的神奇寶貝安息於此
突然間，你在神奇寶貝塔撞見了他，並進行了一場戰鬥。
「勁敵為何出現在神奇寶貝塔.....？」
你勁敵的拉達已經竟然不在他的隊伍裡面了。
是的，拉達已經離開他的隊伍了，但拉達為何會從隊伍中消失了......？「你殺了你勁敵的拉達。」
「你的勁敵之所以會出現在紫苑鎮，就是為了安葬拉達，而拉達就是你殺的。」
沒錯，當時在豪華客船聖安奴號上，你勁敵沒辦法從那混亂的船艙中趕往至神奇寶貝中心
最後導致他心愛的拉達沒了心跳。

#4　[ BW / BW2 奇妙之橋的幽靈 ]
奇妙之橋是合眾地區 15 號道路及 16 號道路之間的一座橋。
在隨機情況下，會在橋上的男性 NPC 旁看見一名疑似小女孩的身影，但是當玩家要靠近她旁邊與她對話時。
小女孩以閃現般的方式消失了。
這時若和旁邊休息站的老奶奶對話
老奶奶會告訴玩家「......你　看到了嗎？當時奇蹟之橋在建造時，附近有位時常和凱西一起遊玩的女孩」「......　......」「......明明這麼有活力」
這事件也在《神奇寶貝 黑 / 白》推出 2 年後發行的《神奇寶貝 黑 2 / 白 2》遊戲中有了後續發展。
在續作的「反轉山」中一棟無人的「外人之屋」內，只要主角每進出不同房間時，房間內的擺設都會有所變動。
然而玩家在探索外人之屋內部時，將會看見一個不斷閃現的小女孩幽靈。
在遇見小女孩的幽靈時，還會和玩家表示「一個可怕的惡夢……無盡的黑暗的惡夢……爸爸，媽媽，凱西……你們在哪裡？」
隨後當玩家再度與幽靈相遇時，則是「在那個黑暗的夢裡……我聽到了爸爸的聲音……忘記那個新月之羽……請和我一起待在這裡吧……。」
其中屋內的書架還留下了下列訊息：
遙遠的神奧地方有一隻叫克雷色利亞的神奇寶貝。它的翅膀像新月一樣，能驅趕走惡夢。
遙遠的神奧地方有一隻叫達克萊伊的神奇寶貝。為了保護自己，它會把人類和神奇寶貝拖入惡夢中。
有的神奇寶貝懂得一種叫做食夢的技能。用這個技能，神奇寶貝可以吃掉處於睡眠狀態的目標的夢，造成傷害的一半體力會恢復到自己身上。
有一種神奇寶貝叫素利普。它催眠其它的生物然後吃掉它們的夢。如果吃到惡夢它就會拉肚子。
有的神奇寶貝擁有一種叫做預知夢的特性。擁有這個特性的神奇寶貝可以看穿對手的技能。高威力的技能更容易被看穿。
最後玩家在 2 樓最深處的房間內撿到道具「月牙之羽」後，女孩的幽靈即時從玩家後方出現，並告訴玩家「啊…這根月牙之羽…我現在不能帶走它了…但一切都會好起來的」「請把它還給那隻神奇寶貝，我一直站在橋上想還給它的那隻神奇寶貝…」
這時玩家再度帶著月牙之羽回到奇妙之橋時，便能遭遇到超能力系的神奇寶貝「克雷色利亞」
終於也完成了小女孩的心願，讓整起事件落幕。

#5[ ORAS 四天王幽靈 ]
神奇寶貝寶石重製版《神奇寶貝 終極紅寶石 / 始源藍寶石》中
許多玩家發現了四天王第二位的幽靈系訓練家所處的房間中，即將和芙蓉戰鬥前對話時
就在畫面轉黑的一瞬間，右邊沙發上會看到有一個類似於雙胞胎中的一個女孩坐在上面
在對話切換角度後，主角側身位置也能看到一張女孩的臉，但對戰結束後就消失了。

可拉可拉＆袋龍的身世
根據官方圖鑑所述，可拉可拉頭戴的骨頭是其母親死亡所遺留下來的，手持的骨頭亦然。
在電影《名偵探皮卡丘》的開頭，主角便調侃了這項設定（指可拉可拉是頭戴屍骨的寶可夢），而悲傷的可拉可拉還存在另一個都市傳說——與袋龍的血緣關係。
袋龍被設定為具有強大的母性，會不惜一切代價保護袋中的小寶寶，
有趣的是，袋龍並無進化的前身，以蛋孵化後會直接獲得已攜帶小寶寶的型態
不少玩家便自行腦補可拉可拉是失去母親的小袋龍，再加上兩者的外型、膚色相似，該種說法廣為流傳。
官方在太陽 月亮當中讓可拉可拉在闖入對戰可呼喚袋龍變相證實了這一都市傳說

紫苑鎮綜合症（紫苑鎮音調/白色鬼手/鬼/活埋人型）
在最初的紅綠版發售後幾日，傳聞忽然有大量的小孩死亡。
據說這些兒童都是在進入紫苑鎮以及神奇寶貝塔之後才出現問題。
至少有200多名兒童死於這些綜合症下，流言聲稱大多數都症狀都是因為帶著耳機聽紫苑鎮音調所引起
流言指根據Game Freak前公司職員佐藤春惠所說
有好幾名7-12歲的小孩因為這些綜合症變的暴躁，眼睛耳朵鼻子流血，而且不是暴斃就是自殺身亡
傳說因為它受到京都內務府的對公司信息披露法保護，至今這件事還沒有被大眾知道
紫苑鎮音調
在雜誌《Game’s Dimensions》的訪談中
開發團隊的關內直表示在初代紅綠版中紫苑鎮被刻意打造成和遊戲中其他地點有點不同
他們在遊戲中使用了兩種不同頻率的聲音，每種頻率只播一邊耳機而讓人造成輕度不安的感覺，也就是雙耳拍頻（binaural beats）
根據簡易的頻譜分析，可以發現該段音樂並沒有雙耳拍頻現象，真正造成不安感的是來自低頻噪音跟不和諧音程
但傳說指這音調對耳朵還沒發育完全的小孩的大腦影響較大，所以傳言指這引起了包括自殺在內的許多問題，於是在之後的版本被更改掉
但是耳朵眼睛鼻子流血怎麼來的
白色鬼手
這是一隻原本遊戲中在神奇寶貝塔三樓能和你對戰的野生神奇寶貝。是一隻皮肉脫落腐爛又露出骨頭的手。
傳說聲稱它有四種獨立的動畫：出場（有叫聲）、閒置和兩種攻擊。兩種攻擊分別是拳擊（Fist）和粗暴（Brutal），拳擊就是出拳，而粗爆的攻擊動畫卻因為少了好幾幀而只有手打開→消失→變回原狀。
Master Hand變成鬼系後的下場
後來在神奇寶貝Origin中真的出現了
鬼
傳說被放置在神奇寶貝塔中好幾個不同的地方。因為無法和玩家進行互動，所以應該是背景專用，總共有59 frame
擷取出來的大半數畫像都是鬼，而剩下的四分之一則是拿來做褪色的效果。但是其中有數格卻包含了屍體、尖叫的臉孔與類似死神的東西，讓人越玩越不安
活埋人型
原本是攻略塔到最後的Boss，現在已被鬼取代。看起來像是隻腐爛的鬼要爬出地面。
傳說指它對主角表示它很寂寞並問主角會不會陪他，然後戰鬥開始。因為沒有玩家打贏它之後的腳本，打贏後遊戲就會當機，唯一能做的就是讓玩家被打敗這什麼無理ゲー
要是玩家被它打敗，活埋人型會說「終於有新鮮的肉吃了」然後把主角拖入地下。
之後就有個主角被活埋人型吞噬了的Game Over畫面別吐槽PM哪裡來的Game Over畫面
更奇怪的是在這之後腳本會用這張圖覆蓋了標題畫面，之後標題畫面就會一直是這張圖

失蹤編號（けつばん/Missing No.）
失蹤編號是四色版裡一隻有名的BUG神奇寶貝，總共有五種不同的形狀：
紅藍版與黃版各一種混雜的狀態、化石盔化石、化石翼龍化石與紫苑鎮的鬼。
要遇到失蹤編號，首先必須去找教你怎麼抓神奇寶貝的老人說話。
在教你怎麼抓的時候，主角的圖像及名字都會變成老人的，而這時主角的名字會被放到一塊不怎麼會讀到的緩衝區裡。
但是在紅蓮島或雙子島遭遇神奇寶貝時，這塊擁有主角名字的記憶體就會被讀取，遊戲便會依玩家名字的資料來決定遇到的是什麼神奇寶貝。
要是玩家名字的十六位進制資料裡沒有一般神奇寶貝的代碼的話，為了防止遊戲發生更嚴重的錯誤，被稱為「失蹤編號」的神奇寶貝就會出來與玩家對戰。
在遇到失蹤編號後，殿堂裡的資料就會永久損毀，道具欄裡第六項道具會增加成128個，然後遊戲會出現暫時性圖像錯誤。
因為牠的名子叫做失蹤編號，有玩家開始懷疑牠們是否為本應在初代中出現，但遊戲製作後期卻被刪除的神奇寶貝。
失蹤編號總共有39種，而其中9種有獨特的叫聲
這些叫聲的資料存在於其他真正神奇寶貝的的叫聲資料們之間，不太可能是垃圾資料。
網路上也有森本茂樹開發過190隻神奇寶貝的傳聞，而151+39=190這件事讓這個推測變得更加可信。

蔓藤怪之谜
据说蔓藤怪是来自在关都21号溺***孩，死后被蔓藤缠著，成为了蔓藤怪，并继续把人类拉下水陪伴它。
由於初代没有女主角，在同人创作中一般认为死者正是第一世代的原女主角
不过所谓的「初代没女主」后来确认只是为了绘制封面而临时设计的角色

耿鬼的秘密
耿鬼的起源有兩個說法，一說是來自皮可西的影子，也有一說是來自被鬼斯通吃掉的皮可西
原因是耿鬼和皮可西不但長得很相似，而且體重和身高十分接近
皮可西的身高為1.3m，體重為40.0 kg；鬼斯通的身高為1.6m，體重只有0.1 kg
巧合的是，耿鬼的身高為1.5m，體重為40.5 kg，幾乎是以上兩者的總和，而且待機型態由浮在半空變成站立，使這個說法更具說服力
第六世代新增Mega進化後，由於Mega耿鬼的待機姿勢與達摩狒狒十分相似，因此兩者又衍生出類似的傳說了
另一個耿鬼的傳說是在紅綠版的時代，搭船去某個地方的話會有一個BUG出現，之後畫面會出現「genga-ha nakahasikoyo」
這句話有兩種翻譯：「原畫是中橋高洋」以及「耿鬼是中橋高洋」
但是第一個發現這個BUG的網友找了找製作名單，並沒有叫做中橋高洋的人
那麼這名畫師也許在遊戲製作還沒結束前就已經離開了，而耿鬼是為了紀念他放進去的，所以鬼斯通進化的耿鬼才會變的那麼像人型
網路上也流傳著在金銀版中將耿鬼的叫聲以慢速倒放就會聽到「nakahasikoyo」