嘉靖之前，九边约计30余万士兵，庚戌之变后嘉靖开始扩军，到了嘉靖末年约计50万，而到万历时期约计60万。

一、从卫所中抽选精装组成营兵。
二、营兵分为战守，类如清制，提督和总兵标营为战兵，而副将以下至把总为守兵。守兵分置塘汛，边关主要承担各堡和烽火台工作，而在内地为保安部队。
三、标营的军官量才授职，而杂鱼部队的军官可以由卫所军官拣选。历史上，明末卫所军官极难任营官的，而且你想任营官得交钱。
四、因为嘉靖疯狂置兵，导致边军得军额极其庞大。那么多人，700多万军饷平摊下来肯定不足够得，所以需要将部分卫所军户内迁，这部分人可以在内地建镇。

军事改革最难三点，
一士兵如何安置。
军户上面有三座大山，一是内监得镇守太监，二是卫所军官，这两个是兼并大户，第三个就是朝廷了。朝廷旧制本来需要所谓行边操和京操，但军户去应了差，回来土地莫名其妙就转到军官帐下了。那朝廷出了个注意，交钱可以去。而且朝廷征收的租粮过于变态了.军户改成民户，按民田纳科，我想他们会举双手双脚赞成的。
卫所精装可以选为战兵和守兵，其中部分安置在九边，部分可以内迁到没有卫所的府，设总兵和镇。
清时绿营百年不加饷，绿营繁衍，物价增长后，士兵连养家都极其困难。但那会绿营除了做小买卖外，另外一项主要收入是去府县当差，押个粮，查个赌，扫个黄，缴个匪之类的，日口粮银三分，要是干一个月的可以有9钱收入。 明朝其实也可以这么干的，将府县的民壮猜测，由分守防汛的守兵来承担这个工作。这样可以按旧例卫所5钱5分给守兵发工资即可。这样大致一月一两多收入，还可以增加地方维稳力量。而战兵肯定不能干这类事的，战兵需要不应差，只操练。

二，军官如何安置
无非两样，一退伍，二创造岗位在就业
军官差不多是卫所改制的最大阻力，但历史上，营兵制大盛后这些人越来越得到实缺，要想拿缺你还得交粮食。这就是陷入恶性循环，只能不停得去薅军户得羊毛，卫所越来越烂。而且卫所大部分都建立在鸟拉不屎得地方，实际是薅不到多少羊毛的。那如果能让他们比较容易得到实缺，可能阻力就没有那么大了。
在古代退伍是不可能退伍的，那只有创造岗位一图了。
岗位主要有三大类，
第一个是卫所改府县后的职官，知县是不可能的，但佐杂之类的应该没问题。武转文乐开花。
第二个新设的分守防汛职官，副将至把总，这也可以安置很多军官。这类基本工作都是维稳，可以让卫所军官来。
第三个作为机动兵力的各提标和镇标中的军官，卫所中的世袭军官有才干的也可以担任。

其实效率最高的还是屯垦制，一个屯垦制，从曹操时代一直到毛时代，2000多年，历代牛B的帝王都喜欢搞屯田，明朝的孙承宗，袁崇焕到孙传庭，都想搞，可惜都没搞成。

三，如何建立体系。
清制绿营的那么多兵力中实际真正作为机动兵力也就是各标营，总督的督标，巡抚的抚标，提督的督标和总兵的镇标。四者兵力差距都不大。虽然提督是一省军政主官，但真正从属于他的仅仅那几千人的督标，而其他的各镇各协各营只是受他统属并不是他从属的，总兵也类似，所以整个清代稳定的很。
而明的边境危机比较严重，可以将山西三镇和陕甘四镇都设置提督总兵官，其他类如北京周围分镇，多设置一些总兵官。提督和总兵的关系类如清代，将兵力分散给领兵官，让他们统领战兵。

很好，清朝的很多制度其实就是明朝制度的改良

其实满清的绿营制度蛮厉害的，以大制小，以小分大。也就是绿营特爱干私活这个槽点.....但清廷的绿营防汛几乎插满全国各地要冲，监视全国百姓，这也是满清极容易将民变扼杀在摇篮中的重要原因。如果明末陕西也是这样，估计就不会四处冒火了....

你这个套路改和不改有啥区别呢？明末真正遇的大敌不过我大清而已。历史上明朝这凑一千那抽二千的玩法被我大清吊打。你这不也一样换汤不换药这凑一千那抽二千的套路嘛。遇到大清不还是被吊打？如果不以大清为假想敌。历史上明朝卫所营兵并行制完全够用根本无需要改。。。。

九边本身需要改变吗？这么漫长的放弃河套的消极防守体系

@skj59
当然以清朝为假想敌了，这里与满清最大的区别是满清各标各营都是分战、守两种兵的，战兵主要是马兵和步兵，守兵是步兵。而满清作为机动兵力的各标营实际能投入作战的兵力极少的，比方福康安的五营督标，满员就2500人，而其中八百人当差，若干守兵，实际真正能投入作战的战兵估计就千把人。
而我这里提标和镇标是全然作为作战兵力的....

按以前的镇守制，包括明朝，是分区防守，这样实际并不可能将总兵副将下属的兵力全部调走的，因为防区需要留兵...所以一将少的几百，多的千把。满清情况也类似....作战也需要全国调兵，然后同镇，同府，同省合并再编。这就是镇守制最大的问题....

而曾剃头当年直隶练兵的时候说过绿营的问题，当差得分，操练得聚，两者是不能兼顾的，所以原则是新的练兵不当差，只练操。