这三个的区别最主要是科室设置不一样，医师人数要求不一样。中西医结合门诊和综合门诊的区别不是很大。
中医门诊设置要求科室设置：至少设有三个中医临床科室；人员要求：（一） 中医药人员占医药人员总数的比例不低于70%；（二） 至少有4名中医师，其中至少有1名具有主治医师以上职称的中医师；（三） 至少有2名护士、1名中药士及相应的检验、放射等技术人员。
中西医结合门诊科室设置：至少设有急诊室、内科、外科；人员要求：（一）至少有3名从事中西医结合临床工作二年以上的医师，其中至少有1名具有副主任医师以上职称的中西医结合医师或中医师；（二）至少有5名护士；（三） 医技科室至少有1名具有相应专业的卫生技术人员。
综合门诊临床设置：至少设有5个临床科室。急诊室、内科、外科为必设科室，妇（产）科、儿科、中医科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、预防保健科等为选设科室；人员要求：（一） 至少有5名医师，其中有1名具有副主任医师以上职称的医师；（二） 每临床科室至少有1名医师；（三） 至少有5名护士，其中至少有1名具有护师以上职称的护士；（四） 医技科室至少有1名相应专业的卫生技术人员。