赤水河地域特有的地理、气候、土壤、水质等条件，加之数千年来经久不息的酿酒活动对微生物的长期驯化和自然筛选作用，从而形成了习酒城酿酒环境特殊的微生物类群。经检测，习酒镇环境中存在的可培养的酿酒微生物菌群相对稳定。空气中常见的可培养的细菌主要有12种、霉菌主要有16种、放线菌3种、酵母菌有5种；土壤中常见的可培养细菌主要有12种、霉菌有11种、放线菌有2种、酵母菌有4种。这些微生物菌群的存在，是酿造优质酱香酒的必要条件和基础条件，正是这些德天独厚的资源，决定习酒独特的品质和风格。