锡伯族信仰萨满教和藏传佛教。
锡伯族的萨满既有女性也有男性。锡伯族的萨满不能世袭。
在锡伯人眼里，当萨满的人都有一定的先兆。锡伯人学萨满白天参加生产，夜晚在家学习，三年才结“业”。学习中最重要的是“上刀梯”，之后要经历挨家挨户祈告仪式、通过十八个卡伦仪式、跳神治病和其他跳神仪式。
跳神治病是锡伯族萨满在萨满教活动中最重要的内容。萨满的主要服饰有：神帽、神裙、铜镜、心镜、神矛、神衣、神鞋和手鼓。
萨满供奉的主神是继承本哈拉前任萨满的主神。萨满举行各项活动和仪式，全靠神灵来指点、帮助，其中主神的作用是最主要的。
藏传佛教传入锡伯族地区始于元代。目前可以说明问题的只有沈阳市俗称“锡伯族家庙”的喇嘛教“太平寺”及其碑文。
锡伯族崇拜一种鲜卑兽。相传，鲜卑兽帮助迷路的锡伯族先民走出了大兴安岭地区。后来，人们为了纪念这头神兽，男人们把它的头像刻在皮带钩上，每当上山打猎时，都要系上它，以示让它引路指方向。
锡伯族的神祇崇拜、灵魂崇拜、祖先崇拜也有鲜明的民族特色。
神祇崇拜：畜神锡伯语称“海尔堪”，它是保佑家畜兴旺发达的神灵；灶神崇拜锡伯语称作“肫依妈妈”；门神，锡伯语称为“杜卡依恩杜里”；还有娘神、河神、山神崇拜，锡伯语称为“卓有恩杜里”；猎神崇拜，称为“班达玛法”。
灵魂崇拜：锡伯族认为人死后就到阴间，阴阳就隔一张纸；同人间一样，吃、喝、住、行、劳作、花钱；人死后因其生前的行善作恶之别，把人再降生成十大类。锡伯族幼童死去，其死尸不埋葬又不火葬，而用襁褓和柳枝裹二层之后，放到野外，尽管让飞禽走兽食之。
祖先崇拜：锡伯族最具特色的祖先崇拜有：喜利妈妈——象征保佑家宅平安和人口兴旺的神灵；海尔堪玛法——锡伯族男性祖先神灵；布尔堪巴克西玛法——锡伯族的佛祖。布尔堪巴克西玛法是具有藏传佛教和原始宗教两重性质的祖先。
锡伯族还保留着对天、地、日、月、星辰等自然现象，石头等自然物及狐狸、蛇、虫王精灵等的崇拜及其祭祀。萨满教信仰依然存在。