1．打造国家级和省级高水平医院。（1）创建国家级高水平医院。成立工作专班，完善工作机制，争创国家临床医学研究中心或分中心，支持中国科大附一院争取委省共建国家医学中心，建成国家儿童、创伤区域医疗中心。再争取若干个国家区域医疗中心和中医药传承创新中心建设项目。（2）建设省级高水平医院。统筹资金、项目、政策等资源，集中支持中国科大附一院、安医大一附院、省中医院、蚌医一附院、弋矶山医院等5家医院，重点打造优势学科群，疑难危重症诊疗能力基本达到苏浙同类医院水平。（3）建设省级区域医疗中心。统筹省市资源，以市为主、省市共建，建设蚌埠、阜阳、芜湖、安庆4个省级区域医疗中心和10—15个省级区域专科医疗中心。
3．构建“1+5+N”传染病医疗救治体系。建设省级传染病救治基地（安徽省公共卫生临床中心）以及合肥、芜湖、蚌埠、阜阳、安庆等区域性传染病救治基地，各市建设1所高水平传染病专科医院或依托三级综合医院建设独立院区。建成1个国家中医疫病防治基地，加快推进省级中西医结合传染病救治基地和芜湖、六安2个区域性传染病救治基地建设，建设1支国家级和10支省级中医疫病防治队伍。强化公立医院公共卫生职能。