注:以下段落为楼主搬运
其实很好理解，可以把艾伦看做两个艾伦，一个是我们现在正在看得这个时间线的艾伦，另一个就是已经超越了时间，在通道里知晓了一切的艾伦，而这个神艾伦，通过进击的巨人的力量，将未来的记忆给现在的艾伦，让他去执行达到自己想要的结果。
但神艾伦也是艾伦，他的目的和初心也是消灭所有的巨人，最开始不成熟，或者说不知道真相，他的做法是击杀的方式，知道真相后，看过所有人的记忆后他逐渐成熟，其实只要让巨人之力消失就行，那就是通过让尤弥尔放下执念，斩断所有巨人诅咒，巨人消失，轮回了无数次做法只有一种，结局也说了，那就是让尤弥尔看到自由的三笠，敢爱敢杀，让她放下执念。
而我们看到的现在的艾伦就是神艾伦的奴隶，按照神艾伦的指引，一步一步达到神艾伦的结局，这个过程是痛苦的，比如知道土豆女死亡这些，但现在的艾伦相信未来的自己，神艾伦，他只能接受痛苦，朝着自己不知道的结果前进，所以现在的他也不知道为什呢要这么做，所以一方面来讲，现在的艾伦确实是奴隶，不是自由的。
但是，最后时间线收束，现在的艾伦在达到最终的结果后，所有的艾伦都和神艾伦统一，这就是始祖的力量，神艾伦选择和不战之约的王族不一样，看过太多后，他仍然选择要救下自己的朋友，为了让巨人之力消失，又让友人活下去，前者只要让三笠爱着自己又杀了自己就行，后者就是让友人们成为英雄，所以总综合起来，就是漫画的结局，所以站在神艾伦的角度下，他和那些悲观的王族不一样，为了彻底斩断锁链，消灭所有巨人，他做出了不一样的选择，从这一点上看，艾伦是自由的。
最后通篇来说，最自由的，或者对整个作品里弘扬自由这个主题最强调的其实是三笠，三笠从爱，到自己的选择，到最后战争结束自己也不接受任何功勋看来，她才是最自由，最纯粹的，明暗两线同时点出，明线自由就是反抗，做出符合内心的，与之不同的选择（神艾伦），暗线真真的自由不是在环境影响下，自己发自内心的情感（三笠）。