病毒载量水平可以反映传染性大小，血液中HIV病毒载量持续低于检测下限（<20或50拷贝/ml，根据不同的检测方法而异），可认为性行为风险传播极低。大多数患者抗病毒治疗后血浆病毒载量4周内应下降1个log以上，在治疗后的3～6个月病毒载量应达到检测不到的水平。然而，一旦感染者体内出现耐药毒株或抗病毒药物的血药浓度下降到一定水平，HIV病毒载量可能反弹，传染能力随之恢复。
我国为正在接受抗病毒治疗者每年至少提供一次免费的病毒载量检测。建议有条件者在抗病毒治疗前应进行病毒载量检测，在开始治疗后4周左右检测1次，然后每3个月检测1次，直到病毒完全抑制。治疗后两年以内，建议每3-4个月检测一次。治疗两年以后，如果病毒稳定抑制,每6月检测一次。以后依据疗效情况酌情调整检测频率。