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痰液NGS在治疗肺部感染中的作用

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肺部NGS检测属于二代基因测序试验检查方法,临床主要用于检测肺部感染性疾病、肿瘤性疾病等,对疾病诊断有辅助作用,可判断感染、肿瘤类型以及指导用药。
1、实验原理:任何真核细胞、微生物、肿瘤细胞等都有特定基因序列,经肺部NGS检测若发现已知特定基因序列,可证明检测样本中含有上述生物物质,有利于后续采取针对性检查。检测前会先将可能出现的特定基因序列模板输入程序后台,以便于设备采样终端对样本进行信息采集时,能够快速与模板信息进行比对;
2、结果认定:肺部NGS测定速度较快,还可同时采集并分析大量样本,检测结果也可较快得出。一旦发现机体存在特定基因序列,需进一步完善血常规、CT、细菌培养等检查,尽早明确诊断。治疗期间进行该检查,通过检测结果可了解病情进展,有利于医生及时调整治疗方案。
综上所述,肺部NGS检测是一种基于基因检测原理的快速生物检测技术,建议检测前先咨询医生建议,根据自身情况制定相应检查计划。
我们先模拟一下一个肺部感染的患者 进医院之后的操作流程
患者会被要求验血 验血能查出血液里面炎症指标高 很难准确查出是细菌真菌还是病毒感染
患者会被要求做CT 通过CT 判断感染的严重程度 CT 也是看不出到底是哪种感染
患者会被要求做痰培养,一般痰培养要3天起步,而且微量的微生物是培养不出来的 说难听点有些不规范的操作也不让痰培养的结果 失去参考意义
在大一点的三甲医院里面 患者可能会被要求做支气管镜,取肺泡灌洗液进行一系列的检查其中也有痰培养之类的
吃免疫抑制剂之后的患者 很可能在做支气管镜的时候要求自费做一个NGS
感染这件事是指数级别的 很多患者尤其是免疫缺陷的患者 一天两天就发展的很快 病菌像入无人之境一样 免疫招呼不了了 如果按照这个流程走完一遍 宝贵的时间都被耽搁了
这个时候做NGS的优势就完全体现出来了
NGS的优势
NGS相比痰培养 速度比较快 一般收到标本之后24小时之内完成基因测序
NGS相比痰培养 会多出一些病菌的耐药的参考 比如查到什么细菌或者病毒之后 一般会给出耐药性 耐的这些药就可以排除掉 用的话起不了太大的作用
NGS的精度比痰培养要高很多,很多微量的细菌病毒还有真菌都可以查到 还可以精确查到属类里面的详细名字
目前做NGS的方法
NGS 在大部分医院里面都是外送的 要自费 不到4K块 在很多医院的呼吸科里面NGS是跟支气管镜绑定在一起的,对于免疫缺陷患者 尤其是间质肺病人群体 吃过免疫抑制剂的患者 是强烈不建议做支气管镜的 很多医院操作不规范 做支气管镜的时候会带进去一些病菌 而且带进去的往往是耐药的病菌 得不偿失 搞不好要命
另外一种NGS的方法是取早上的深口痰 检测的效果理论上跟肺泡灌洗液是一样的 优点是不用做支气管镜
在医生的指导下 自己在家也是可以做NGS的 需要联系到厂家发痰盒 自己采集标本 然后寄给机构 静等结果然后让医生解读
自己送NGS采集标本的时候要求比较高。手不能碰到痰盒里面 早上取深口痰的时候 尽量取比较浓稠的部分 可以一天分批次几个标本 然后让机构帮混合之后检测
标本的运送是要干冰桶来完成的,冰袋达不到那么低的问题 而且DNA是会降解的 可以跟厂家申请 寄干冰桶
NGS结果的解读
这是一个很重要的事 我们把前面的工作都做完之后 医生不会解读等于白浪费钱



这个NGS的结果就是检测到有鲍曼不动杆菌感染 而且是耐药型的 医院常用的对抗鲍曼的药都产生耐性了 只能想办法找其他的药 往往这种药都很贵,这个患者如果不做NGS 就算痰培养出来鲍曼 使用四环素类还有磺胺类的药还是没用 可能在试药的时候 病人都没挺过来。 多说一句 这个鲍曼耐药菌 大概率就是做支气管镜的时候带进去的 平常感染鲍曼 很少有耐药的 除非在医院的环境

这是另外一个患者 检测到肺部有曲霉菌属,结合患者是肺部是蜂窝状了 大致可以判断 蜂窝状里面可能包裹很多曲霉菌 是一个典型的真菌感染, 如果不结合患者症状还有肺部CT 很多医生是会直接忽略掉背景生物
总结:免疫缺陷患者 遇到肺部感染的时候 不要怕花钱 尽早做一个NGS 跟感染抢时间,如果医院能在不做支气管镜的时候采集痰液标本做NGS是最好的情况,NGS 在以后可能会全面取代痰培养 成为指导医生用药的强有力依据
如果有关于间质肺炎相关的问题 可以私聊我 我们可以一起探讨


IP属地:河南1楼2022-10-22 10:54回复