1.肛门视诊：用两手拇指轻轻分开病人的臀部，观察肛门及周围有无脱出物，外痔、瘘口、脓肿、肛裂等。
2.直肠指诊：又称肛指检查。检查者右手戴上手套或右食指戴上指套，涂润滑油，用右手食指前端放在肛门口，待病人适应后再轻轻插入肛门口，先试验肛门括约肌的松紧度，然后对肛管直肠四周依次进行检查。
3.肛镜检查肛镜涂润滑油，缓慢插入肛门，由深至浅观察直肠粘膜颜色，检查完毕将肛镜慢慢往外退出，边退边观察直肠和齿线附近有无病变。