新疆土壤的颜色主要以棕褐色居多，还有一些地区的土壤呈现浅黄色和灰色。棕褐色土壤是受到天然条件所形成的，常见于沙漠、内陆高原等干燥地区，它表现出深棕和淡棕灰色，显示出异常的粗糙，其中富含大量的矿物质和泥沙，非常适合用于作物种植，具有很好的水收效果。浅黄色土壤则多见于河流河谷，主要由含有沙砾的沉积物组成，土壤质地较软，可以较好地保存水分，并有效控制水土流失。灰色土壤则常见于湖泊沿岸或者河流旁，有时也会受到气候影响而出现在其它地区，它主要是由沉积物、淤泥、水等组成，能够很好地保持土壤湿度，有助于盐碱地的恢复和植物生长。新疆土壤性质也是各地不同的，有砂质土壤、粉质土壤、砂质贫瘠土壤、塬碱性砂质土壤、超碱性砂质土壤、碳酸钙土壤等。