芝麻应存放于干燥，光线充足，温度低于10℃的通风环境中。一般来说，可以将芝麻用塑料袋包装好后放入冰箱冷藏室里，用保鲜膜将袋口封住，以防止芝麻水分流失、变质而腐烂。如果芝麻种子太多，不能一次性将其扔进冰箱，可以分拣成小包装，再将小包装放入冰箱冷藏室里保存，这样可以有效避免芝麻种子因长时间接触冰箱环境而变质。芝麻也可以在洁净、干燥、阴凉、通风处放置，比如厨房收纳柜、置物架等。但这样的储存方式会使得芝麻受到湿气、温度、光照等外界因素的影响，因此芝麻的保存期会相对短一些，一般也只能保存3-6个月。