如果长途大巴在高速路上收取了应该由车辆支付的通行费，可以通过多种方式进行举报。可以向交通管理部门、公安机关等相关部门投诉举报，也可以拨打交通运输服务热线进行反映。如果在网上购票或是使用第三方软件购票，也可以通过平台客服进行投诉举报。同时，也可以要求公开车票收费明细，并要求车辆在高速路上缴纳应付的通行费。