雅鲁藏布江水文特征是旱季和湿季的交替，每年11月开始旱季，在下一个月及接下来的6月中水位维持较低水平，7月开始湿季，8月份几乎覆盖整个流域，到11月再次是旱季。雅鲁藏布江年径流量在中国陆地年径流量中位居前三，影响很大，保证了流域区域的生态环境。雅鲁藏布江支流出水量大，湿季流量丰沛，历史上曾为运河施工，作用十分重要。