铜绿假单胞菌可以通过多种方法进行隔离，其中最常用的是使用含有碱性琼脂的培养基（如MacConkey琼脂）或含有铜离子的培养基（如Cetrimide琼脂）。另外，也可以通过培养土壤、水样、医院环境等样品来筛选铜绿假单胞菌。