不会退档，因为退档是指当一门专业的招生人数超过学校可招生计划时，学校会将部分有关专业的报名退回，从而使招生总人数控制在可招生计划内。如果学校只有两个专业，那么就没有必要执行退档政策，因此不会发生退档现象。