河南科技大学临床医学院涧西区老校区荒废的原因主要是因为学校进行了校区整合，将临床医学院迁至新校区，老校区因此失去了使用价值。此外，老校区建筑年代久远，设施老旧，无法满足现代化教学和生活需求，也是导致荒废的原因之一。