账务处理程序的根本区别在于登记的账目不同。登记明细分类账的依据和方法是按照每一笔交易的具体内容进行分类和记录，而登记总分类账则是按照账户的性质和用途进行分类和记录。明细分类账更加详细和具体，适用于小型企业或个人财务管理；总分类账则更加简洁和概括，适用于大型企业或机构的财务管理。