是的，星期日可以预约科目三考试。根据《机动车驾驶证申领和使用规定》第六十六条的规定，机动车驾驶证考试可以在节假日安排，任何一个星期六、星期日都可以进行考试。即使周日也可以进行科目三考试，只需要确保考试规定的时间和地点，还有考试日期。