多肽链的合成方向通常是从N端到C端，在多肽合成中，一般采用固相合成法，或者是液相合成法，而这两种又有什么区别呢，今天小编在下面给大家做详细的解答。

多肽化学合成方法，包括液相和固相两种方法，液相合成方法主要应用在短肽合成，如力肽，催生素等，其相对与固相合成，具有保护基选择多，成本低廉，合成规模容易放大的许多优点，与固相合成比较，液相合成主要缺点是，合成范围小，一般都集中在10个氨基酸以内的多肽合成，还有合成中需要对中间体进行提成，时间长，工作量大，固相合成主要采用FMOC和BOC两种方法，它具有合成方便，迅速，容易实现自动化，而且可以比较容易的合成30个氨基酸左右多肽。
20种比较常见氨基酸，可根据侧链可分为几种类型：脂肪族氨基酸（Ala，Gly，Val，Leu，Ile，），芳香族氨基酸（Phe，Tyr，Trp，His），酰胺或羧基侧链氨基酸（Asp，Glu，Asn，Gln），碱性侧链氨基酸（Lys，Arg），含硫氨基酸（Cys，Met），含醇氨基酸（Ser，Thr），亚氨型基酸（Pro）。活性肽化学合成中氨基酸保护是非常关键的，直接决定了自动合成能够取得成功的关键。是因为常见的20中氨基酸中有很多是含有活性侧链的，需要进行保护，要求是，这些保护基在自动合成过程中稳定，无副反应，自动合成结束之后可以完全定量的脱除。自动合成过程中需要进行保护的氨基酸包含：Cys，Asp，Glu，His，Lys，Asn，Gln，Arg，Ser，Thr，Trp，Tyr。需要进行保护的官能团：羟基，羧基，巯基，氨基，酰胺基，胍基，吲哚，咪唑等。这其中Trp也可以不用保护，是因为吲哚性质比较稳定。当然在特殊的情形下，有一些氨基酸也可以不用保护，象，Asn，Gln，Thr，Tyr。
氨基酸侧链保护官能团特别多，相同的侧链有各种不同的保护基，可以在不同的条件下选择性的脱除，这点在环肽及其活性肽修饰方面具有很重要的意义。并且侧链保护基和所选择的合成方法有密切关系，液相和固相不太一样，固相中BOC和FMOC策略也不一样，从某种程度上看，活性肽化学就是氨基酸保护基的灵活运用与搭配。Cys比较常见的保护基有三种，Trt，Acm，Mob，这三个保护基可以完成多对二硫键活性肽的合成。Lys比较常见的保护基有：Boc，Fmoc，Trt，Dde，Allyl，这些对于固相自动合成环肽提供了很多正交的保护策略。Asp比较常见的保护基有：Otbu，OBzl，OMe，OAll，OFm，同样的也提供了多种正交的保护策略。
目前多肽合成中，大多采用羧基活化方式来完成接肽反应，最早采用的是将氨基酸活化为酰氯，叠氮，对称酸酐及其混合酸酐的方法，但是因为这些条件下，存有氨基酸消旋，及其反应试剂危险及其制备比较复杂，慢慢被后来的缩合试剂代替，依照它的结构可以分两种：缩合试剂主要有：碳二亚胺型，鎓盐型（Uronium）。
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