2005年，战南美青年足球锦标赛，梅西代表阿根廷队参赛，在9场比赛中6次替补出场。梅西在与委内瑞拉的比赛中当选全场最佳球员，并在2-1力克巴西队的三四名决赛中打进制胜球，成功帮助阿根廷获得世青赛资格。

在2005年的国际足联世界足球青年锦标赛上，利昂内尔·梅西代表阿根廷队参赛。梅西在本届世青赛中牢牢占据了主力的位置，他在首发的每场比赛都有参与到球队的进球进攻当中，在世青赛的决赛，梅西上演了梅开二度，帮助阿根廷队夺得U-20世界杯冠军。

本届比赛梅西的表现十分优异，除了第一场比赛，阿根廷对阵美国的比赛梅西没有首发以外，其余的比赛梅西都成为了阿根廷队的固定首发，且梅西在本届杯赛中以6个进球获得金靴奖，以亮眼的表现获得了本届世青赛的最佳球员。

2005年的友谊赛，由阿根廷国家男子足球队对阵匈牙利国家男子足球队。梅西在本场比赛身披18号球衣登场，完成了自己阿根廷成年国家队的首秀.在10月份的南美区世界杯预选赛上，梅西首次作为阿根廷国家队的首发登场，并跟随球队获胜。

2005/06赛季，利昂内尔·梅西与巴塞罗那足球俱乐部续约至2010年，巴萨将梅西的违约金上调为1.5亿欧元。在同年的9月，巴萨又对梅西的合同进行了修改，梅西将会和巴萨续约至2014年，且梅西获得了西班牙国籍，将不再占用球队的非欧名额。