色氨酸可以合成五羟色胺（维持人精神稳定的营养）。五羟色胺也会引起幻觉，曾被用于迷幻药物。
无羟色胺也可合成褪黑激素。
色氨酸有毒，色氨酸过高会影响胰岛素分泌。
无羟色胺代谢剩余的部分转化为烟酸（烟酸亦可帮助戒烟）
多余的色氨酸代谢不掉会产生黄尿酸，黄尿酸影响胰岛素分泌。而维生素b6可以代谢色氨酸