正常有机肥发酵的温度主要通过翻堆和强制通风来调控，一般遵循“时到不等温、温到不等时”的原则，既在发酵前期，既使发酵起温缓慢甚至不起温，，48h后必须翻堆或通风，避免堆体形成厌氧环境;在高温阶段当堆温低于50℃，应及时翻堆(氧气减少，导致堆体内反应逐渐减少，从而温度降低)，提高堆温，促进有机物分解和杀死有害微生物;在发酵后期，一旦温度超过65℃，必须及时翻堆，防止有机物质碳化和氨化。