由于植物性神经紊乱的症状多样且可能涉及多个系统，因此在诊断时需要进行全面的体格检查和排除性诊断。医生可能会询问患者的症状、病史，并进行血常规、生化全项、头颅CT及磁共振成像、腹部超声、胃肠镜、心脏彩超、24小时动态心电图等相关检查，以排除其他器质性疾病。