借用一下吧友的分析
古代历史上没有一个是灭九族的，灭三组的都是少之又少。这种人估计和小胡子差不多
宇智波和千手放下了世仇，其他家族见到了和平的可能性，才一起建立木叶，说宇智波是战俘是不恰当的，没有宇智波，木叶建不起来。
第一次叛乱，斑被扉间猜忌加上石碑误导，决定带族人离开木叶，族人切割了斑，代表他们是木叶的宇智波一族，站在木叶这边。这也是为什么后续斑开九尾炸木叶，柱间没有连坐到其他宇智波的原因。搞连坐本来就不合理历史上都没有灭九族的
第二次叛乱，柱间和斑死后，扉间转脸就剥夺了宇智波的选举权让他们去当警察，曾经宇智波以为木叶把他们当朋友看，现在发现把自己当狗看，于是今日欢呼马达啦，只缘妖雾又重来，出现了小规模叛乱，很快被镇压（注意是扉间先搞事）
第三次叛乱，九尾之乱。fw木叶六年了查不出真凶，也不撤销对宇智波的制裁，还是剥夺了他们的领地六年，宇智波忍了六年才反已经很有素质了，有罪推定放哪里都是逆天的。