如果公司发现自己被他人代开发票，这可能涉及到税务违法行为，需要立即采取以下措施：
1. 内部调查：
- 确认被代开发票的具体情况，包括发票的种类、金额、用途等。
- 查明是公司内部人员所为还是外部人员非法使用公司信息。
2. 停止支付：
- 如果发现发票与实际业务不符，应立即停止支付相关款项。
3. 保留证据：
- 保留所有与代开发票相关的资料，包括发票、合同、通讯记录、银行流水等。
4. 报告税务机关：
- 及时向税务机关报告情况，提供相关证据，配合税务机关进行调查。
5. 法律咨询：
- 咨询专业律师，了解可能面临的法律风险和应对措施。
6. 对外声明：-
如有必要，对外发布声明，澄清事实，减少对公司声誉的损害。
7. 加强内部控制：
- 审视并加强公司的内部控制和风险管理，防止类似事件再次发生。
8. 配合调查：
- 如果涉及刑事犯罪，积极配合公安、税务等部门的调查。
9. 追究责任：
- 如果代开发票是由公司内部人员所为，应追究其责任，包括可能的纪律处分和法律追究。
10. 修正账务：
- 如果已经入账的错误发票，需要进行账务调整，确保财务报表的真实性和准确性。
以下是具体的应对步骤：
- 立即行动：一旦发现被代开发票，应立即采取行动，不要延误。
- 详细记录：记录下发现问题的过程、时间、涉及的人员和具体事项。
- 保护现场：如果涉及实物证据，应保护好现场，不要随意变动。
- 内部通报：向公司高层通报情况，根据公司规定采取相应措施。
- 外部协调：与税务机关、警方等外部机构保持沟通，按照他们的指导进行操作。
代开发票是严重的违法行为，可能会导致公司面临税务处罚、刑事责任以及声誉损失。因此，公司必须高度重视，及时妥善处理。