如何确定circRNA的下游功能靶点LIG1？

组学发现：作者通过RNA-seq技术，检测沉默circRNA的PANC-1/GEM耐药株细胞与对照细胞，发现739个差异基因， 包括520个上调基因和219个下调基因。这些差异基因在多种DNA损伤修复通路中富集，包括碱基切除修复、错配修复和核苷酸切除修复。在这些通路中，包含显著下调的共同基因LIG1。LIG1是DNA连接酶家族的成员，在几乎所有DNA损伤修复通路中发挥着重要作用。
应答检测：在GEM抵抗的PDAC组织中，LIG1也高度表达，并且与PDAC组织中的circRNA表达呈正相关。沉默circRNA后，LIG1的mRNA和蛋白表达水平降低，而过表达则增加LIG1的表达。
回复验证：通过体内和体外实验证实，LIG1能够逆转circRNA对细胞增殖、凋亡和DNA损伤的影响。沉默LIG1会导致细胞增殖减少、凋亡增加和DNA损伤增加，而过表达LIG1则能够逆转由circRNA沉默引起的这些变化。
结论：circRNA通过诱导LIG1的表达来减少DNA损伤、促进细胞增殖和降低凋亡，从而增强细胞对GEM的抵抗性。

全文分享：【《Molecular Cancer》文献解读： 巧用IP/RIP/ChIP/ChIRP探究circRNA促进胰腺AI耐药的调控网络】。