(1)AARS1作为一种蛋白质乳酸转移酶,使用乳酸作为直接的乳酸供体
第一步,AARS1与乳酸存在结合
分子对接预测乳酸可以很容易地结合到AARS1的催化口袋上(图1a)。等温滴定量热法验证了该结果(图1b)。
第二步,确定AARS1是一种乳酸转移酶
体外乳酸化实验显示AARS1能够以依赖于乳酸和ATP的方式直接使组蛋白H3和H4乳酸化(图1c),随后的质谱分析也显示AARS1能直接在K18处乳酸化H3肽(图1d)。AARS1催化袋内氨基酸残基突变体(5M)消除了其乳酸转移酶活性(图1c-d)。表明乳酸结合对AARS1介导的蛋白乳酸化的必要性,并且AARS1直接使用乳酸作为乳酸供体。
第三步,AARS1可以直接与乳酸结合并将其转移到赖氨酸
由于L-丙氨酸与AARS1的亲和力略高于乳酸,因此在反应体系中加入L-丙氨酸可剂量依赖性地抑制AARS1介导的组蛋白H3乳酸化。表明AARS1可以直接与乳酸结合并将其转移到赖氨酸(图1e-f)。 另外,敲低AARS1可降低蛋白质的乳酸化水平(图1g)。表明AARS1以ATP为能量源,乳酸为供体,直接催化蛋白质的乳酸化。
(2)AARS1易位到细胞核是对细胞内乳酸增加的反应
第一步,乳酸处理促进AARS1进入细胞核
质核分离实验发现,乳酸处理促进AARS1穿梭进入细胞核(图1h)。分析AARS1的氨基酸序列,发现其C端区域有一个进化保守的核定位信号(NLS)基序(图1i)。构建ΔNLS突变体,检测显示该突变体仅定位于细胞质中;此外,乳酸处理对ΔNLS突变体也没有作用(图1j)。
第二步,确定乳酸促进AARS1核易位的机制
具有NLS的蛋白质通常通过与输入蛋白α的相互作用被转运到细胞核中。乳酸化蛋白质组学显示,输入蛋白α亚基(KPNA1、3、4和6)被乳酸化。Co-IP实验发现KPNA4是AARS1的结合伙伴(图1k)。此外,Co-IP实验提示,乳酸促进AARS1与KPNA4互作,AARS1-ΔNLS突变体则消除这种互作(图1l)。表明KPNA4与AARS1的NLS基结合,介导其核转运。
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图1
全文分享可查阅:【《JCI》解读:肿瘤乳酸化修饰与泛素化修饰对抗!丙烯酰tRNA合成酶AARS1乳酸化修饰YAP复合体促进信号传导】。
第一步,AARS1与乳酸存在结合
分子对接预测乳酸可以很容易地结合到AARS1的催化口袋上(图1a)。等温滴定量热法验证了该结果(图1b)。
第二步,确定AARS1是一种乳酸转移酶
体外乳酸化实验显示AARS1能够以依赖于乳酸和ATP的方式直接使组蛋白H3和H4乳酸化(图1c),随后的质谱分析也显示AARS1能直接在K18处乳酸化H3肽(图1d)。AARS1催化袋内氨基酸残基突变体(5M)消除了其乳酸转移酶活性(图1c-d)。表明乳酸结合对AARS1介导的蛋白乳酸化的必要性,并且AARS1直接使用乳酸作为乳酸供体。
第三步,AARS1可以直接与乳酸结合并将其转移到赖氨酸
由于L-丙氨酸与AARS1的亲和力略高于乳酸,因此在反应体系中加入L-丙氨酸可剂量依赖性地抑制AARS1介导的组蛋白H3乳酸化。表明AARS1可以直接与乳酸结合并将其转移到赖氨酸(图1e-f)。 另外,敲低AARS1可降低蛋白质的乳酸化水平(图1g)。表明AARS1以ATP为能量源,乳酸为供体,直接催化蛋白质的乳酸化。
(2)AARS1易位到细胞核是对细胞内乳酸增加的反应
第一步,乳酸处理促进AARS1进入细胞核
质核分离实验发现,乳酸处理促进AARS1穿梭进入细胞核(图1h)。分析AARS1的氨基酸序列,发现其C端区域有一个进化保守的核定位信号(NLS)基序(图1i)。构建ΔNLS突变体,检测显示该突变体仅定位于细胞质中;此外,乳酸处理对ΔNLS突变体也没有作用(图1j)。
第二步,确定乳酸促进AARS1核易位的机制
具有NLS的蛋白质通常通过与输入蛋白α的相互作用被转运到细胞核中。乳酸化蛋白质组学显示,输入蛋白α亚基(KPNA1、3、4和6)被乳酸化。Co-IP实验发现KPNA4是AARS1的结合伙伴(图1k)。此外,Co-IP实验提示,乳酸促进AARS1与KPNA4互作,AARS1-ΔNLS突变体则消除这种互作(图1l)。表明KPNA4与AARS1的NLS基结合,介导其核转运。
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图1
全文分享可查阅:【《JCI》解读:肿瘤乳酸化修饰与泛素化修饰对抗!丙烯酰tRNA合成酶AARS1乳酸化修饰YAP复合体促进信号传导】。