在进行呼和浩特大肠平滑肌肉瘤基因检测时，是否需要双方一起，主要取决于检测的目的和具体需求。
1. 单个样本检测：如果是为了评估个体本身的患病风险或进行疾病确诊，通常只需要患者本人提供样本进行基因检测即可。这种情况下，不需要双方一起。
2. 家族遗传风险评估：如果检测目的是为了评估家族遗传风险，了解家族中是否存在相关基因突变，可能需要患者及其直系亲属（如父母、兄弟姐妹）一起进行基因检测。这样可以更全面地评估家族遗传倾向。
3. 配偶或子女检测：在某些特殊情况下，如需评估配偶或子女的患病风险，可能也需要他们一起参与基因检测。
综上所述，是否需要双方一起进行呼和浩特大肠平滑肌肉瘤基因检测，应根据具体检测目的和医生建议来决定。建议在检测前咨询专业医生或遗传咨询师，以获得更准确的指导。